More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3936 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3936  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 308 aa  629  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328889  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3846  ribose operon repressor  73.17 
 
 		 287 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1023  putative sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  74.56 
 
 		 287 aa  435  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4128  putative sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  73.17 
 
 		 287 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.070286 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4214  putative sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  75.26 
 
 		 287 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4013  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  72.82 
 
 		 287 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4326  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  72.82 
 
 		 287 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4237  putative sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  74.56 
 
 		 287 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3860  ribose operon repressor  71.78 
 
 		 287 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4173  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  72.82 
 
 		 287 aa  423  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2803  regulatory protein LacI  64.94 
 
 		 308 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.578503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.18 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 		 323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  39.63 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  39.63 
 
 		 323 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  38.7 
 
 		 323 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  39.32 
 
 		 323 aa  222  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  39.32 
 
 		 323 aa  222  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  39.32 
 
 		 323 aa  222  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  39.32 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  39.01 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  39.01 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  34.57 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  34.56 
 
 		 324 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  33.54 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 		 334 aa  145  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  29.08 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0119  ribose operon repressor RbsR  31.61 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  29.22 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  29.69 
 
 		 338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  29.82 
 
 		 332 aa  135  8e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  30.54 
 
 		 337 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  30.36 
 
 		 334 aa  135  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  30.13 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  30.91 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.53 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  29.7 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.53 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.53 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0300  transcriptional regulator, LacI family  27.49 
 
 		 339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.6 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1712  sucrose operon repressor  30.72 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.772811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  28.35 
 
 		 333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  28.35 
 
 		 333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  28.35 
 
 		 333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  28.35 
 
 		 333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  28.35 
 
 		 333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00486  transcriptional regulator LacI family  29.19 
 
 		 331 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.52 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.39 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1640  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  26.36 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  29.32 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.3 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  30.33 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.82 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  29.62 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  29.01 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  28.48 
 
 		 338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  30.06 
 
 		 336 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  29.46 
 
 		 340 aa  125  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.48 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  30.03 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  28.35 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  28.4 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  29.5 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  30.33 
 
 		 340 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0343  transcriptional regulator, LacI family  29.88 
 
 		 327 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0271  transcriptional regulator, LacI family  27.27 
 
 		 342 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  28.79 
 
 		 338 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1780  sucrose operon repressor  28.57 
 
 		 330 aa  122  9e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000248781 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.91 
 
 		 339 aa  122  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  27.66 
 
 		 348 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  27.81 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  27.66 
 
 		 337 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  31.27 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  28.23 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.81 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  29.13 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1803  LacI family transcription regulator  27.78 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00004995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0120  LacI family transcription regulator  27.08 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1069  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  27.96 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.209088 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.53 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.61 
 
 		 330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  27.83 
 
 		 332 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  27.49 
 
 		 330 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  28.79 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0588  LacI family transcription regulator  27.96 
 
 		 328 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.979882  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0527  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  27.96 
 
 		 328 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  29.21 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  27.83 
 
 		 332 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1692  sucrose operon repressor ScrR  27.81 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  28.1 
 
 		 346 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  27.19 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  27.19 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  27.19 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  27.83 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  27.83 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  27.93 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>