More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4173 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4173  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  100 
 
 
287 aa  588  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4237  putative sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  96.86 
 
 
287 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4013  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  91.29 
 
 
287 aa  541  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3846  ribose operon repressor  91.29 
 
 
287 aa  542  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4326  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  91.29 
 
 
287 aa  541  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4128  putative sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  91.29 
 
 
287 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.070286 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3860  ribose operon repressor  89.2 
 
 
287 aa  528  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1023  putative sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  85.02 
 
 
287 aa  488  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4214  putative sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  83.97 
 
 
287 aa  484  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3936  LacI family transcription regulator  72.82 
 
 
308 aa  441  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2803  regulatory protein LacI  60.98 
 
 
308 aa  359  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.578503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.51 
 
 
323 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  37.84 
 
 
323 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  37.84 
 
 
323 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  37.5 
 
 
323 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  37.5 
 
 
323 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  37.5 
 
 
323 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 
323 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  37.5 
 
 
323 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  37.16 
 
 
323 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  37.16 
 
 
323 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  37.5 
 
 
323 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  35.29 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  35.41 
 
 
324 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  32.35 
 
 
325 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 
334 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1640  LacI family transcription regulator  28.76 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0119  ribose operon repressor RbsR  28.42 
 
 
328 aa  120  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  28.9 
 
 
332 aa  119  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  27.07 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  28.85 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.07 
 
 
341 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  29.26 
 
 
333 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1069  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  29.35 
 
 
328 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.209088 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1780  sucrose operon repressor  31.21 
 
 
330 aa  115  8.999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000248781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0527  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  29.35 
 
 
328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1712  sucrose operon repressor  28.76 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.772811  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.98 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0588  LacI family transcription regulator  29.35 
 
 
328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.979882  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.53 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.13 
 
 
337 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.21 
 
 
341 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  27.56 
 
 
334 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  28.21 
 
 
338 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  28.9 
 
 
332 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0343  transcriptional regulator, LacI family  29.81 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0837  alanine racemase  32.18 
 
 
337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0604  LacI family transcription regulator  31.87 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00243454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  27.83 
 
 
333 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  26.95 
 
 
337 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  28.01 
 
 
346 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.65 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  27.83 
 
 
333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  27.83 
 
 
333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  27.83 
 
 
333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  27.83 
 
 
333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.65 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  28.43 
 
 
340 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.65 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1214  transcriptional regulator, LacI family  29.51 
 
 
333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000107104  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  28.29 
 
 
333 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  26.89 
 
 
326 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.32 
 
 
335 aa  109  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  27.97 
 
 
336 aa  109  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1803  LacI family transcription regulator  26.62 
 
 
327 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00004995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  28.48 
 
 
339 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 
332 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  29.67 
 
 
347 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00486  transcriptional regulator LacI family  26.67 
 
 
331 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  27.83 
 
 
331 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  27.33 
 
 
334 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.97 
 
 
341 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  27.12 
 
 
346 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  26.62 
 
 
337 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  29.62 
 
 
336 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  26.21 
 
 
348 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  25 
 
 
349 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  27.65 
 
 
334 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  27.61 
 
 
331 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  26.95 
 
 
361 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1692  sucrose operon repressor ScrR  30.58 
 
 
320 aa  106  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0300  transcriptional regulator, LacI family  26.71 
 
 
339 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1245  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 
337 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  27.3 
 
 
330 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1086  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  29.41 
 
 
325 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  26.69 
 
 
337 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.16 
 
 
339 aa  106  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0271  transcriptional regulator, LacI family  26.49 
 
 
342 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3432  transcriptional regulator, LacI family  28.52 
 
 
336 aa  105  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000329456  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0983  LacI family transcription regulator  28.34 
 
 
338 aa  105  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  0.446903 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.47 
 
 
342 aa  105  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  28.25 
 
 
340 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  26.12 
 
 
339 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.68 
 
 
332 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  28.62 
 
 
332 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  26.95 
 
 
334 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1186  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  29.08 
 
 
337 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1002  LacI family transcription regulator  29.08 
 
 
337 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  27.51 
 
 
334 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1164  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  29.08 
 
 
337 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>