69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7426 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7426  citrate synthase-like  100 
 
 		 412 aa  799    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0339716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6135  citrate synthase-like protein  85.1 
 
 		 416 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822109  normal  0.0240059 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6508  citrate synthase-like protein  86.71 
 
 		 414 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6017  citrate synthase-like protein  87.15 
 
 		 416 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.03442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5652  citrate synthase-like  87.15 
 
 		 416 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3155  citrate synthase-related protein  56.17 
 
 		 383 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1463  citrate synthase-related protein  56.17 
 
 		 383 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0125  citrate synthase-related protein  56.17 
 
 		 383 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2891  citrate synthase-related protein  56.17 
 
 		 383 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0520  citrate synthase-related protein  55.92 
 
 		 383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0704  hypothetical protein  55.92 
 
 		 383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0982036  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0538  citrate synthase-related protein  55.92 
 
 		 383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0221269  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6702  citrate synthase  37.84 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3867  citrate synthase  28.37 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  23.42 
 
 		 380 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8311  citrate synthase  30.51 
 
 		 277 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4677  citrate synthase  29.94 
 
 		 257 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1379  citrate synthase  24.45 
 
 		 257 aa  49.7  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3119  citrate synthase  28.44 
 
 		 254 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1586  methylcitrate synthase  27.17 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000154256  normal  0.49975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4013  citrate synthase  30.34 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4946  citrate synthase  27.27 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.094047  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  23.25 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  27.17 
 
 		 385 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2009  citrate synthase  29.61 
 
 		 261 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.884105 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6707  methylcitrate synthase  26.79 
 
 		 389 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4355  methylcitrate synthase  26.79 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  25.46 
 
 		 373 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  26.56 
 
 		 383 aa  47.4  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1313  citrate synthase  29.61 
 
 		 262 aa  47  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  23.68 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5862  methylcitrate synthase  26.79 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2728  citrate synthase  27.27 
 
 		 255 aa  46.6  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02719  methylcitrate synthase  28.19 
 
 		 384 aa  47  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.966086  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3288  methylcitrate synthase  26.19 
 
 		 390 aa  46.6  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281405  normal  0.014196 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.27 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5653  citrate synthase  29.37 
 
 		 268 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.47 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0404  methylcitrate synthase  23.27 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.67 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3860  methylcitrate synthase  26.79 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3974  methylcitrate synthase  26.79 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0651061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2329  methylcitrate synthase  26.06 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00287  2-methylcitrate synthase  24.28 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0364  methylcitrate synthase  24.28 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3292  methylcitrate synthase  24.28 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3273  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.28 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1809  methylcitrate synthase  27.38 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0398  methylcitrate synthase  24.28 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1039  citrate synthase  28.74 
 
 		 255 aa  44.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00291  hypothetical protein  24.28 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4451  methylcitrate synthase  27.97 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230042  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4144  citrate synthase  27.27 
 
 		 284 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00479182  normal  0.482128 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0357  methylcitrate synthase  24.28 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1347  methylcitrate synthase  27.51 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1815  Citrate synthase  28.04 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4153  citrate synthase  30.9 
 
 		 284 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23220  methylcitrate synthase  24.39 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4041  citrate synthase  30.9 
 
 		 284 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6860  methylcitrate synthase  26.19 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632501  normal  0.17935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4790  methylcitrate synthase  27.16 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6081  methylcitrate synthase  26.19 
 
 		 389 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.662054 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0142  methylcitrate synthase  25 
 
 		 390 aa  43.1  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2081  methylcitrate synthase  26.16 
 
 		 404 aa  43.1  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847456  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  33.91 
 
 		 410 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5388  methylcitrate synthase  25 
 
 		 390 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0798  citrate synthase 3  28.48 
 
 		 370 aa  43.1  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.036744  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0121  methylcitrate synthase  25 
 
 		 387 aa  43.1  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>