More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6935 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6935  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
300 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.2 
 
 
280 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1115  sugar ABC transporter, permease protein  36.74 
 
 
285 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0469179  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
276 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.190746 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
275 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232263  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11560  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.74 
 
 
301 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.626059  hitchhiker  0.00742077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
298 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370604  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
285 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
279 aa  157  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8234  maltose transport protein  37.4 
 
 
271 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367769  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
283 aa  155  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000390677  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
275 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150437  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
282 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437147  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.95 
 
 
290 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548355  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3249  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.84 
 
 
284 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
282 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.454019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
297 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
270 aa  152  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
295 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
299 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
282 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
276 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000118681  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
278 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
279 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169914  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
278 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.98 
 
 
300 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
273 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00118636  normal  0.712976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2764  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.3 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2049  sugar ABC transporter (permease)  33.46 
 
 
303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907779  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23830  ABC-type sugar transport system, permease component  31.2 
 
 
303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
294 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2253  sugar ABC transporter (permease)  31.91 
 
 
281 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
281 aa  145  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
277 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
294 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
279 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0981879  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
275 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
277 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0760  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.43 
 
 
280 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312496  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
279 aa  143  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
281 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0887  sugar ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 
280 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453961  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
275 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  34.23 
 
 
280 aa  142  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7705  sugar ABC transporter (permease)  33.08 
 
 
301 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
315 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
275 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
298 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06510  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.59 
 
 
282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
287 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  31.92 
 
 
277 aa  140  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
291 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
303 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5530  sugar ABC transporter (permease)  33.47 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.30156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 
279 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
279 aa  139  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
297 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  31.11 
 
 
280 aa  139  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
280 aa  139  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
275 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
286 aa  138  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
277 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.062682  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
283 aa  138  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2070  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
297 aa  138  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0665879  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
276 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0827234 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  32.52 
 
 
277 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  31.8 
 
 
278 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  33.08 
 
 
276 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
301 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
274 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
277 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
303 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  32.96 
 
 
275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 
305 aa  136  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709644  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
278 aa  136  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.194848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.85 
 
 
316 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3987  putative sugar ABC transporter (permease protein)  33.46 
 
 
282 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
273 aa  136  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00970334  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 
275 aa  136  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
404 aa  136  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.463288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  33.73 
 
 
277 aa  136  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
279 aa  136  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
284 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31520  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.08 
 
 
303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.424225  normal  0.830973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>