54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1354 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  96.6 
 
 
471 aa  852    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1254  dual specificity protein phosphatase  89.69 
 
 
467 aa  716    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  90.66 
 
 
468 aa  808    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1354  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
471 aa  917    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302883  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  96.6 
 
 
471 aa  852    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1279  dual specificity protein phosphatase  88.53 
 
 
467 aa  715    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594668  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4013  dual specificity protein phosphatase  52.52 
 
 
464 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0008  dual specificity protein phosphatase  48.1 
 
 
445 aa  346  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.851139  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3658  putative dual specificity phosphatase  48.91 
 
 
444 aa  332  8e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5538  dual specificity phosphatase, catalytic domain protein  43.58 
 
 
451 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2698  hypothetical protein  47.61 
 
 
449 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31730  hypothetical protein  47.37 
 
 
437 aa  292  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00205255  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4660  Dual specificity protein phosphatase  43.6 
 
 
449 aa  287  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2884  Dual specificity protein phosphatase  40.68 
 
 
437 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.170107  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2877  putative phosphatase protein  43.39 
 
 
447 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510949  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2361  putative dual specificity phosphatase  38.51 
 
 
428 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2234  putative dual specificity phosphatase  37.73 
 
 
438 aa  237  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1172  Dual specificity phosphatase catalytic subunit  36.02 
 
 
428 aa  236  6e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0267685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3080  putative dual specificity phosphatase  38.13 
 
 
439 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3002  PAP2 family phosphatase  38.13 
 
 
439 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1291  PAP2 family phosphatase  38.13 
 
 
439 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  37.87 
 
 
438 aa  233  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  37.87 
 
 
430 aa  233  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1631  PAP2 family protein  37.5 
 
 
430 aa  232  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832741  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1761  PAP2 family protein  37.27 
 
 
430 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113055 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01378  hypothetical protein  37.27 
 
 
430 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01366  predicted phosphatase, inner membrane protein  37.27 
 
 
430 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2014  PAP2 family protein  37.64 
 
 
430 aa  229  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1592  PAP2 family protein  37.05 
 
 
430 aa  229  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  35.9 
 
 
478 aa  209  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02972  dual specificity phosphatase, catalytic domain protein  52.99 
 
 
132 aa  126  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  33.87 
 
 
550 aa  107  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  29.44 
 
 
545 aa  94.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  32.51 
 
 
540 aa  94  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  30.48 
 
 
533 aa  93.6  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  29.44 
 
 
563 aa  93.6  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  29.44 
 
 
568 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  29.44 
 
 
563 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  29.44 
 
 
563 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  30.67 
 
 
565 aa  90.5  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  30.67 
 
 
565 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  29.44 
 
 
560 aa  88.6  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  30.52 
 
 
565 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  30.1 
 
 
547 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  28 
 
 
552 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  28.73 
 
 
581 aa  76.6  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
246 aa  67  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1848  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.57 
 
 
238 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  27.34 
 
 
169 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2865  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.423571 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4138  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.93 
 
 
217 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4419  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.8 
 
 
217 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2666  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.65 
 
 
202 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000403275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1383  dual specificity protein phosphatase  34.44 
 
 
167 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>