50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2906 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  99.57 
 
 		 235 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  98.72 
 
 		 235 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  93.93 
 
 		 235 aa  394  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  92.06 
 
 		 240 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  90.19 
 
 		 240 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  73.02 
 
 		 267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  73.02 
 
 		 244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  73.02 
 
 		 244 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  73.02 
 
 		 244 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  73.02 
 
 		 244 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  72.9 
 
 		 258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  72.56 
 
 		 267 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3142  hypothetical protein  52.31 
 
 		 237 aa  205  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.917118  normal  0.0747759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.35 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  44.64 
 
 		 242 aa  191  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3261  hypothetical protein  43.17 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2055  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  40.78 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1908  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.68 
 
 		 267 aa  161  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000035223  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  40.74 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2206  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.54 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0148894  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1538  hypothetical protein  67.71 
 
 		 125 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.313345  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4028  hypothetical protein  42.55 
 
 		 280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1915  hypothetical protein  31.75 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000228464  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  31.69 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  37.93 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1537  hypothetical protein  78.05 
 
 		 82 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01055  hypothetical protein  42.47 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  38.6 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1368  hypothetical protein  39.07 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15910  hypothetical protein  38.43 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  32.6 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  30.56 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  33.7 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  30.92 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  38.85 
 
 		 298 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  32.21 
 
 		 314 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  35.91 
 
 		 361 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  29.06 
 
 		 305 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  37.68 
 
 		 351 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  32.32 
 
 		 270 aa  48.5  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  32.66 
 
 		 270 aa  48.5  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  36.22 
 
 		 348 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  32.39 
 
 		 361 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  28.76 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  29.29 
 
 		 347 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  29.51 
 
 		 320 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  30.19 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  28.63 
 
 		 320 aa  42  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  31.46 
 
 		 340 aa  42  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>