49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1353 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6476  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  338  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1353  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  338  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5471  hypothetical protein  77.51 
 
 		 169 aa  240  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019699 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6066  hypothetical protein  94.55 
 
 		 152 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184002  normal  0.0421173 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3123  YciE  65.09 
 
 		 169 aa  207  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220644  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2998  YciE  65.09 
 
 		 289 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272257  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1349  hypothetical protein  65.09 
 
 		 290 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932547  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2257  hypothetical protein  54.44 
 
 		 169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0390342  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3115  hypothetical protein  54.44 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11100  hypothetical protein  52.66 
 
 		 169 aa  185  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3829  hypothetical protein  50 
 
 		 168 aa  167  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1646  protein YciE  44.31 
 
 		 168 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4046  hypothetical protein  49.69 
 
 		 168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1598  hypothetical protein  44.91 
 
 		 168 aa  157  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299464 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1416  YciE  44.91 
 
 		 168 aa  157  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1862  YciE  44.91 
 
 		 168 aa  157  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1920  hypothetical protein  44.91 
 
 		 168 aa  157  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252481  hitchhiker  0.0000515566 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1857  hypothetical protein  44.91 
 
 		 168 aa  157  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.53745 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1888  hypothetical protein  44.91 
 
 		 168 aa  157  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0168584 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3516  hypothetical protein  49.11 
 
 		 169 aa  154  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4157  hypothetical protein  47.62 
 
 		 168 aa  155  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1366  hypothetical protein  44.31 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1455  hypothetical protein  44.31 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609485  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2370  hypothetical protein  44.31 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.454918  hitchhiker  0.000000143978 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01241  hypothetical protein  44.31 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01231  hypothetical protein  44.31 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2391  protein of unknown function DUF892  44.31 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373261  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3795  hypothetical protein  48.43 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139146  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5519  hypothetical protein  45.12 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.445596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3128  hypothetical protein  43.71 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0330  hypothetical protein  43.45 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.600353  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1355  hypothetical protein  44.08 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0605  hypothetical protein  36.54 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  38.51 
 
 		 161 aa  95.1  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1900  hypothetical protein  34.93 
 
 		 164 aa  94.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1875  hypothetical protein  46.74 
 
 		 92 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5805  protein of unknown function DUF892  34.04 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1759  hypothetical protein  35.56 
 
 		 169 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2899  protein of unknown function DUF892  33.11 
 
 		 169 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2776  hypothetical protein  33.11 
 
 		 169 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3003  protein of unknown function DUF892  33.11 
 
 		 169 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0688  hypothetical protein  37.04 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0583127  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1493  protein of unknown function DUF892  34.84 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5650  hypothetical protein  31.13 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0139  protein of unknown function DUF892  30.61 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207704  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3797  protein of unknown function DUF892  27.89 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4547  hypothetical protein  30.25 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  33.33 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2256  hypothetical protein  30.15 
 
 		 169 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>