50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0149 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  99.57 
 
 
235 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  99.15 
 
 
235 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  93.93 
 
 
235 aa  394  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  92.06 
 
 
240 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  90.19 
 
 
240 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  73.49 
 
 
267 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  73.49 
 
 
244 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  73.49 
 
 
244 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  73.49 
 
 
244 aa  304  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  73.49 
 
 
244 aa  304  7e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  73.02 
 
 
267 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  72.9 
 
 
258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.78 
 
 
238 aa  206  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3142  hypothetical protein  52.31 
 
 
237 aa  206  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.917118  normal  0.0747759 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  44.64 
 
 
242 aa  193  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3261  hypothetical protein  43.17 
 
 
250 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2055  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  41.18 
 
 
264 aa  167  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1908  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.08 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000035223  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  41.2 
 
 
225 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1538  hypothetical protein  68.75 
 
 
125 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.313345  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2206  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.54 
 
 
280 aa  135  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0148894  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4028  hypothetical protein  42.98 
 
 
280 aa  135  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1915  hypothetical protein  31.75 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000228464  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  31.69 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  37.93 
 
 
246 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1537  hypothetical protein  78.05 
 
 
82 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01055  hypothetical protein  42.47 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  38.6 
 
 
244 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1368  hypothetical protein  39.07 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15910  hypothetical protein  38.43 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  32.6 
 
 
329 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  30.56 
 
 
343 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  30.92 
 
 
324 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  33.7 
 
 
348 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  38.85 
 
 
298 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  36.46 
 
 
361 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  37.68 
 
 
351 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  32.21 
 
 
314 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  29.06 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  33.52 
 
 
361 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  35 
 
 
348 aa  48.5  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  32.66 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  32.32 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  29.29 
 
 
347 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  29.92 
 
 
320 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  29.69 
 
 
305 aa  45.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  29.03 
 
 
320 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  31.46 
 
 
340 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  30.19 
 
 
210 aa  42.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>