32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3954 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3954  CHRD domain containing protein  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal  0.0638434 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1194  hypothetical protein  39.81 
 
 		 531 aa  63.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2087  CHRD domain containing protein  45.78 
 
 		 729 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.090076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  32.76 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  30.07 
 
 		 479 aa  52.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  38.05 
 
 		 408 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37354  predicted protein  34.86 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0263858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2374  CHRD domain containing protein  34.02 
 
 		 174 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000109429  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  31.97 
 
 		 282 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  37.5 
 
 		 412 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0338  CHRD domain containing protein  32.38 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  35.04 
 
 		 411 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  35.04 
 
 		 413 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1716  CHRD  29.63 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.344065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2501  CHRD domain containing protein  30.59 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  33.65 
 
 		 862 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2054  CHRD domain-containing protein  28.47 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.332284  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  35.71 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  27.52 
 
 		 513 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  28.89 
 
 		 199 aa  43.5  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  30.92 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  32.23 
 
 		 407 aa  42  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  29.57 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  29.57 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  29.57 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  29.57 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  29.57 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  29.27 
 
 		 819 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  31.07 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  30.7 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  34.27 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  30.1 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>