39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2374 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2374  CHRD domain containing protein  100 
 
 		 174 aa  347  5e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000109429  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2501  CHRD domain containing protein  38.46 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1194  hypothetical protein  46.91 
 
 		 531 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3954  CHRD domain containing protein  40.21 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal  0.0638434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0338  CHRD domain containing protein  36.21 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2066  hypothetical protein  38.89 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  32.56 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1716  CHRD  36.61 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.344065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  37.12 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  36.73 
 
 		 479 aa  52  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  35.65 
 
 		 408 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  34.92 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3749  CHRD domain-containing protein  28.91 
 
 		 139 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4998  CHRD domain-containing protein  29.01 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0402  hypothetical protein  46.55 
 
 		 80 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5370  hypothetical protein  28.26 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.847309  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5325  hypothetical protein  27.69 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5634  hypothetical protein  27.69 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.946842  hitchhiker  0.0000000000653167 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4898  hypothetical protein  28.26 
 
 		 137 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5053  hypothetical protein  27.54 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4883  hypothetical protein  27.54 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  34.15 
 
 		 411 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  35.25 
 
 		 412 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5438  hypothetical protein  27.54 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5294  hypothetical protein  27.54 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000867603 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0939  CHRD domain-containing protein  28.26 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  40.58 
 
 		 819 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5315  hypothetical protein  27.54 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  29.73 
 
 		 513 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  34.88 
 
 		 413 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2087  CHRD domain containing protein  32.35 
 
 		 729 aa  42.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.090076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  31.93 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2054  CHRD domain-containing protein  30.47 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.332284  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  34.51 
 
 		 862 aa  40.8  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>