More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3714 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
294 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
275 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
277 aa  179  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
275 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
299 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
322 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171707  normal  0.684803 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.44 
 
 
297 aa  165  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 
283 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
276 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0403  putative integral membrane transport protein  33.08 
 
 
279 aa  162  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
299 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
278 aa  162  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
278 aa  162  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
289 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.023138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
289 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
289 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
281 aa  161  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
275 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
295 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
282 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
275 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
278 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
253 aa  158  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25430  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.96 
 
 
275 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0542318  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
281 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  33.09 
 
 
275 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
279 aa  155  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1103  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.64 
 
 
283 aa  155  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216355  normal  0.105298 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
285 aa  155  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
275 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.62 
 
 
278 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
283 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  33.1 
 
 
280 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
283 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
277 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
280 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
279 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
273 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
281 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06510  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.31 
 
 
282 aa  152  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
296 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
281 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
275 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
294 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
289 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062951  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
288 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
278 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.63 
 
 
296 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
294 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
286 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.85 
 
 
305 aa  148  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
289 aa  148  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872391  normal  0.176709 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.3 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  30.25 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  30.25 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
293 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
316 aa  146  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235146  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
293 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
290 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
295 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
277 aa  145  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
278 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.368954 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.92 
 
 
276 aa  145  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
295 aa  145  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352716  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
278 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
278 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.898469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
289 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
277 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
291 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.05565  normal  0.793563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0760  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.98 
 
 
280 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312496  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
298 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370604  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
292 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.95 
 
 
283 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000390677  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
275 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0549  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpE  32.95 
 
 
272 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
316 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.75 
 
 
297 aa  143  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
297 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03720  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.22 
 
 
298 aa  143  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.39 
 
 
283 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
281 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.07 
 
 
295 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
281 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 
269 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
279 aa  142  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.398115  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
284 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>