More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2329 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2329  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
281 aa  552  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2137  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.22 
 
 
299 aa  276  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0440159 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0332  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.64 
 
 
272 aa  269  4e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9079  rRNA methylase protein  54.72 
 
 
274 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16290  rRNA methylase  50.38 
 
 
289 aa  251  7e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.484728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0573  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.07 
 
 
272 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0856  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.43 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3677  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.88 
 
 
286 aa  123  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1222  RNA methyltransferase  28.73 
 
 
267 aa  122  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0117794  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1087  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.35 
 
 
266 aa  122  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199948  normal  0.0146207 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1853  RNA methyltransferase  29.1 
 
 
257 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683239  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2141  RNA methyltransferase  27.61 
 
 
257 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0038  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.75 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.260618 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1437  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.37 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0053  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.87 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.87191  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1374  RNA methyltransferase  27.47 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2397  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.55 
 
 
266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.004624  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0612  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.23 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.356127 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01710  rRNA methylase  37.5 
 
 
271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.43805 
 
 
-
 
NC_004310  BR0150  RNA methyltransferase  31.85 
 
 
297 aa  109  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0145  RNA methyltransferase  31.85 
 
 
297 aa  109  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1093  23S rRNA methyltransferase  27.44 
 
 
264 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000062165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1618  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.3 
 
 
267 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000197241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3823  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.33 
 
 
261 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0827889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2051  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28 
 
 
254 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154178  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2845  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.4 
 
 
269 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164972  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1083  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.93 
 
 
263 aa  106  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29895  normal  0.337706 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0537  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.82 
 
 
266 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0842858  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0162  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.16 
 
 
294 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3055  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.88 
 
 
236 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.91 
 
 
272 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000452495  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2224  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.18 
 
 
262 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3036  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.18 
 
 
261 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142554  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2063  putative rRNA methylase  40 
 
 
275 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00825348  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05620  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.22 
 
 
270 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147427  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2993  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.77 
 
 
248 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.246575  normal  0.0568105 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2787  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.34 
 
 
261 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4676  RNA methyltransferase, TrmH family  31.27 
 
 
265 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90567e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4457  RNA methyltransferase  31.27 
 
 
254 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4305  23S rRNA methyltransferase  31.27 
 
 
254 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0650881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4805  RNA methyltransferase  31.27 
 
 
254 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00212295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4688  RNA methyltransferase  31.27 
 
 
254 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000546426  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1293  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.49 
 
 
260 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11661  23S rRNA methyltransferase tsnR  42.86 
 
 
260 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08786  putative rRNA methylase  26.67 
 
 
264 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2978  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.77 
 
 
248 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3022  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.77 
 
 
248 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4295  23S rRNA methyltransferase  31.27 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4688  RNA methyltransferase, TrmH family  31.27 
 
 
254 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000539995  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1866  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.16 
 
 
261 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0975592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5480  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.25 
 
 
272 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666691  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0566  RNA methyltransferase, TrmH family  31.27 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000331759  hitchhiker  0.0000000100751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2517  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.54 
 
 
266 aa  99.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.06 
 
 
248 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.515948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0025  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.08 
 
 
286 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152428 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4673  RNA methyltransferase, TrmH family  31.27 
 
 
265 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0414  rRNA methylase  42.76 
 
 
294 aa  98.6  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1225  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  24.91 
 
 
267 aa  98.6  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314273  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0683  spoU rRNA methylase family protein  28.73 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.827085  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1483  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.84 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000016152 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0306  TrmH family tRNA methyltransferase  29.27 
 
 
268 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2462  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.15 
 
 
237 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1357  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.77 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4393  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.5 
 
 
254 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000250925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3142  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.84 
 
 
496 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0306284  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2661  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.12 
 
 
256 aa  96.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0863  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.78 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1107  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.88 
 
 
260 aa  96.3  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2169  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.57 
 
 
261 aa  95.9  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000507695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3250  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.79 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3068  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.57 
 
 
283 aa  95.9  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.914691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5040  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.5 
 
 
260 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.2 
 
 
246 aa  95.5  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2951  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.77 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5314  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.48 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300522  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3145  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.77 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00100034  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1035  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.49 
 
 
262 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3094  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.7 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922753  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3166  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.83 
 
 
264 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.197409  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2415  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.78 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.64 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2650  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.46 
 
 
254 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00276989  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3173  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.95 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0121288  normal  0.209756 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1819  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.13 
 
 
269 aa  94  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.175485  normal  0.555192 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0769  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.77 
 
 
267 aa  93.2  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21880  rRNA methylase  40.52 
 
 
295 aa  93.2  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0406  RNA methyltransferase  31.58 
 
 
244 aa  93.2  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0940631  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1270  RNA methyltransferase  34.64 
 
 
251 aa  92.4  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.907902  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1906  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.37 
 
 
260 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.602195 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1196  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.5 
 
 
246 aa  92.4  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1218  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.5 
 
 
246 aa  92.4  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  28.52 
 
 
277 aa  92.4  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1419  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  30.48 
 
 
259 aa  92.4  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.253348  normal  0.0498541 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.33 
 
 
315 aa  92.4  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2037  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.37 
 
 
260 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.859577  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2042  RNA methyltransferase  31.67 
 
 
281 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542367  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3539  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.9 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0474859  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1272  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.97 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479292  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2053  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.75 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.625975  normal  0.133256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2142  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.58 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00455486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>