295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0238 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0238  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  100 
 
 
337 aa  661    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0106  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  51.05 
 
 
359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00590  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  47.44 
 
 
354 aa  255  6e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0768874 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0190  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  44.59 
 
 
339 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2125  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  47.84 
 
 
320 aa  243  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000980876 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2367  Deleted entry  48.84 
 
 
323 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38264  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0051  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  45.21 
 
 
323 aa  232  8.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.756837  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0936  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  47.18 
 
 
317 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0266258  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5027  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.03 
 
 
298 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641097  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0482  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.21 
 
 
291 aa  206  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.41 
 
 
294 aa  203  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02690  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.57 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3083  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.1 
 
 
296 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0275518  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3307  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.02 
 
 
300 aa  189  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4919  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.27 
 
 
306 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.79 
 
 
300 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.921353  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2667  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.45 
 
 
300 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167357  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2862  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.79 
 
 
300 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03550  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.93 
 
 
281 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.96 
 
 
308 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0444121  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2925  methylenetetrahydrofolate reductase  37.87 
 
 
305 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2878  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.22 
 
 
313 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.856826  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5126  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.23 
 
 
291 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170004  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5069  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.75 
 
 
281 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1406  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.19 
 
 
303 aa  186  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3477  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.2 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112199  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1345  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.87 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  hitchhiker  0.000920684 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0991  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.04 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232217  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3250  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.8 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.670776  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0364  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.28 
 
 
304 aa  183  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1050  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.29 
 
 
312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466663  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2676  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.79 
 
 
300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1723  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.18 
 
 
303 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0459  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.72 
 
 
281 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.46 
 
 
298 aa  182  7e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.695264  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2831  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.91 
 
 
317 aa  182  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0284  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.61 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.819527  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1450  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.85 
 
 
303 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.337062  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2618  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.24 
 
 
300 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444292  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1572  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.95 
 
 
315 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4187  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.98 
 
 
292 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1081  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.1 
 
 
308 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0517774  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.21 
 
 
300 aa  179  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.0231956 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2896  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.02 
 
 
286 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0488  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.5 
 
 
281 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7060  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.66 
 
 
305 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.377124  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4977  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.15 
 
 
295 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2788  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  39.18 
 
 
310 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.419297  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.85 
 
 
281 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5281  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.81 
 
 
281 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0215  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.33 
 
 
276 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.474341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3109  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.23 
 
 
309 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4850  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.15 
 
 
281 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0546784 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2192  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.67 
 
 
288 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.723025  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05590  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.72 
 
 
290 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03524  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.79 
 
 
295 aa  175  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1105  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.75 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0497695  normal  0.0196735 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3198  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.31 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000417891  hitchhiker  0.000803821 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0185  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  33.88 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.72 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.85 
 
 
276 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1089  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.1 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0091  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase oxidoreductase protein  38.19 
 
 
276 aa  172  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1822  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.33 
 
 
285 aa  172  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00652514  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1647  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.11 
 
 
289 aa  172  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.150812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1498  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.91 
 
 
296 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00302896  normal  0.843154 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1552  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.02 
 
 
290 aa  171  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000427747  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2438  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.46 
 
 
302 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24213  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0117  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.87 
 
 
279 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.08621 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3544  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.5 
 
 
306 aa  170  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.373461 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0035  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.91 
 
 
312 aa  170  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0491  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.63 
 
 
276 aa  170  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3789  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.44 
 
 
299 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3955  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.58 
 
 
294 aa  169  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1723  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.01 
 
 
289 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3335  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.5 
 
 
276 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3658  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.5 
 
 
276 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0099  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  31.33 
 
 
291 aa  169  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.47967  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0624  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.34 
 
 
296 aa  169  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3734  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.14 
 
 
298 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.130481  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4784  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  33.55 
 
 
297 aa  168  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000375918 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0448  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.76 
 
 
281 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1108  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.13 
 
 
289 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0191  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  33 
 
 
298 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3996  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  31.77 
 
 
310 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5917  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.5 
 
 
275 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0219  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.12 
 
 
310 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4039  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.68 
 
 
296 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3547  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.14 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1055  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.73 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3805  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  33.22 
 
 
294 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4093  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  33.22 
 
 
294 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0123  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  33.22 
 
 
294 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4223  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.09 
 
 
295 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480979  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.34 
 
 
296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0642  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.45 
 
 
298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1122  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.69 
 
 
309 aa  166  8e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.476308 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4033  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.78 
 
 
296 aa  165  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.231217 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.51 
 
 
314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.424699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03827  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.44 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>