121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5561 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5561  metal-dependent hydrolase-like protein  100 
 
 		 307 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3737  metal-dependent hydrolase-like protein  98.37 
 
 		 307 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4526  metal-dependent hydrolase-like  87.95 
 
 		 305 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3837  metal-dependent hydrolase-like protein  87.95 
 
 		 305 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0372117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3688  metal-dependent hydrolase-like protein  87.95 
 
 		 305 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2259  metal-dependent hydrolase-like  87.62 
 
 		 307 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0372522  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4904  metal-dependent hydrolase-like protein  87.76 
 
 		 303 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  hitchhiker  0.000304166 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0906  hypothetical protein  75.36 
 
 		 302 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0555  hypothetical protein  76.43 
 
 		 302 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0628824  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2610  hypothetical protein  75.36 
 
 		 302 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2472  hypothetical protein  75.36 
 
 		 302 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1791  hypothetical protein  70.36 
 
 		 293 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000624384 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4877  membrane protein  72.96 
 
 		 293 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000561399  normal  0.621694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4017  metal-dependent hydrolase  66.42 
 
 		 301 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279425  normal  0.558393 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4070  metal-dependent hydrolase  65.33 
 
 		 301 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.954367  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5624  metal-dependent hydrolase  62.54 
 
 		 301 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1473  hypothetical protein  61.74 
 
 		 304 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3692  metal-dependent hydrolase  62.85 
 
 		 301 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4676  metal-dependent hydrolase  62.85 
 
 		 301 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2523  hypothetical protein  64.23 
 
 		 304 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0560  hypothetical protein  64.23 
 
 		 304 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259074  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1345  hypothetical protein  64.23 
 
 		 304 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1007  metal-dependent hydrolase  64.23 
 
 		 304 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1143  metal-dependent hydrolase  61.86 
 
 		 301 aa  359  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316817  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4528  metal-dependent hydrolase  61.77 
 
 		 301 aa  358  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1268  hypothetical protein  64.68 
 
 		 298 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0169  hypothetical protein  60 
 
 		 296 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0463  hypothetical protein  59.51 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1341  hypothetical protein  60 
 
 		 296 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2739  hypothetical protein  60 
 
 		 296 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.910549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2596  hypothetical protein  60 
 
 		 296 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0196  hypothetical protein  60 
 
 		 296 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1012  hypothetical protein  59.21 
 
 		 284 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3601  FF domain-containing protein  56.34 
 
 		 290 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2446  hypothetical protein  51.88 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1177  hypothetical protein  51.88 
 
 		 306 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1703  hypothetical protein  51.5 
 
 		 294 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0723  hypothetical protein  51.5 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0738  hypothetical protein  51.5 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1250  metal-dependent hydrolase  51.5 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1556  hypothetical protein  51.5 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3015  FF domain protein  51.19 
 
 		 298 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3362  FF domain protein  51.53 
 
 		 298 aa  261  8e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3790  hypothetical protein  41.64 
 
 		 278 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1930  metal-dependent hydrolase-like protein  44.27 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2091  metal-dependent hydrolase  42.26 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3653  metal-dependent hydrolase-like protein  40.55 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44510  hypothetical protein  42.07 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.319734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2618  metal-dependent hydrolase-like protein  40.07 
 
 		 278 aa  178  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00276728  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4691  hypothetical protein  41.95 
 
 		 277 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53530  hypothetical protein  41.95 
 
 		 277 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3654  metal-dependent hydrolase-like protein  38.46 
 
 		 281 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0083  metal-dependent hydrolase-like protein  41.09 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0165  hypothetical protein  37.54 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4103  FF domain-containing protein  40.15 
 
 		 285 aa  169  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.852892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4513  metal-dependent hydrolase  38.19 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0738  metal-dependent hydrolase  37.16 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0667904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2960  hypothetical protein  35.02 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1350  FF domain-containing protein  35.36 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.0894985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2822  hypothetical protein  38.7 
 
 		 267 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000149451  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2084  FF domain-containing protein  34.01 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4593  metal-dependent hydrolase  36.73 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4629  metal-dependent hydrolase  38.06 
 
 		 289 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0932  FF domain-containing protein  33.57 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438166  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0314  metal-dependent hydrolase  37.55 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3199  metal-dependent hydrolase  35.64 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3261  metal-dependent hydrolase  35.64 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3208  metal-dependent hydrolase  35.64 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3135  hypothetical protein  36.19 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2354  hypothetical protein  33.58 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19546  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5371  hypothetical protein  35.22 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.971328 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3084  hypothetical protein  29.13 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.531586  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12790  hypothetical protein  31.62 
 
 		 356 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.89049  normal  0.675408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2251  putative metal-dependent hydrolase  29.13 
 
 		 311 aa  89  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000117397  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4911  metal-dependent hydrolase  27.72 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4340  hypothetical protein  28.69 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8730  hypothetical protein  29.43 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1296  FF domain protein  28.52 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0684567  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4392  metal-dependent hydrolase  28.98 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0453  hypothetical protein  31.5 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0464  hypothetical protein  31.5 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.416793  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0440  hypothetical protein  31.5 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1360  metal-dependent hydrolase  26.74 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3648  metal-dependent hydrolase  28.36 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3397  metal-dependent hydrolase  28.04 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4970  metal-dependent hydrolase  27.54 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_003296  RS02367  hypothetical protein  31.25 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5316  metal-dependent hydrolase  27.54 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.14239 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0303  hypothetical protein  29.52 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0708  metal-dependent hydrolase  27.31 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1809  FF domain-containing protein  26.18 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3179  hypothetical protein  29.94 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.17273  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2874  hypothetical protein  26.69 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2918  hypothetical protein  26.69 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2904  hypothetical protein  26.69 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3425  hypothetical protein  30.38 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1193  FF domain-containing protein  28.42 
 
 		 440 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0958504  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0221  hypothetical protein  27.66 
 
 		 434 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0052  hypothetical protein  27.66 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0366  hypothetical protein  27.66 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>