49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4389 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4967  hypothetical protein  96 
 
 		 425 aa  841    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139442  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4389  phosphoserine phosphatase  100 
 
 		 425 aa  882    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3400  twin-arginine translocation pathway signal  96 
 
 		 527 aa  843    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5319  hypothetical protein  96.24 
 
 		 425 aa  842    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0878389  normal  0.0141688 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7058  hypothetical protein  84 
 
 		 424 aa  751    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.291657 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4908  phosphoserine phosphatase  97.88 
 
 		 425 aa  852    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.433606 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0700  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  71.86 
 
 		 476 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0085  hypothetical protein  71.94 
 
 		 517 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712977  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0881  hypothetical protein  72.19 
 
 		 433 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2471  hypothetical protein  71.94 
 
 		 433 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0283788  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0338  hypothetical protein  71.94 
 
 		 519 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.249122  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0637  hypothetical protein  71.94 
 
 		 517 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210974  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1041  phosphoserine phosphatase  71.68 
 
 		 519 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0878  hypothetical protein  71.43 
 
 		 433 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717121  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8503  hypothetical protein  54.24 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287647  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0244  putative lipoprotein  42.27 
 
 		 440 aa  329  6e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.482265  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3340  hypothetical protein  40.61 
 
 		 424 aa  301  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3280  hypothetical protein  36.2 
 
 		 422 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.439147  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1977  hypothetical protein  33.07 
 
 		 396 aa  212  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0094  hypothetical protein  31 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000042098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0335  hypothetical protein  25.44 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3709  hypothetical protein  26.65 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43537  normal  0.241243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5130  hypothetical protein  25.61 
 
 		 351 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4738  hypothetical protein  25.67 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.171999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0144  hypothetical protein  25.82 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69592  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0627  hypothetical protein  25.82 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0436  hypothetical protein  25 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5003  hypothetical protein  25.2 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0243051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0595  hypothetical protein  25.61 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.164758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5182  hypothetical protein  24.9 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69870  phosphorylcholine phosphatase  25.54 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5359  hypothetical protein  26.05 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0528  hypothetical protein  25.55 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2758  hypothetical protein  24.65 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0552  hypothetical protein  25 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6065  phosphorylcholine phosphatase  24.02 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1127  hypothetical protein  23.28 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5556  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  33.33 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2251  nonspecific acid phosphatase precursor  37.84 
 
 		 339 aa  57  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3052  nonspecific acid phosphatase  33.93 
 
 		 336 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2133  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like  31.67 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2981  NapD-like protein  33.33 
 
 		 340 aa  50.4  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0598995  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2894  putative nonspecific acid phosphatase precursor  32.14 
 
 		 364 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851127  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6682  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  32.69 
 
 		 365 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4528  nonspecific acid phosphatase precursor napD-like protein  30.36 
 
 		 358 aa  47  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0141528  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1196  NapD-like protein  29.2 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0900  NapD-like protein  29.46 
 
 		 341 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8071  NapD-like protein  28.57 
 
 		 346 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1241  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.83 
 
 		 333 aa  43.1  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>