36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5003 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_5003  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  727    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0243051  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5130  hypothetical protein  98.86 
 
 		 351 aa  721    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0335  hypothetical protein  92.88 
 
 		 351 aa  660    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5182  hypothetical protein  96.87 
 
 		 351 aa  707    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5359  hypothetical protein  82.32 
 
 		 353 aa  608  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0436  hypothetical protein  80.4 
 
 		 352 aa  597  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4738  hypothetical protein  80.97 
 
 		 352 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.171999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6065  phosphorylcholine phosphatase  76.58 
 
 		 349 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69870  phosphorylcholine phosphatase  76.28 
 
 		 349 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0552  hypothetical protein  59.88 
 
 		 352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0528  hypothetical protein  59.88 
 
 		 352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0595  hypothetical protein  59.37 
 
 		 352 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.164758 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0144  hypothetical protein  59.37 
 
 		 352 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69592  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0627  hypothetical protein  59.37 
 
 		 352 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112871  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3709  hypothetical protein  59.37 
 
 		 352 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43537  normal  0.241243 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2758  hypothetical protein  57.64 
 
 		 352 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1977  hypothetical protein  25.2 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3340  hypothetical protein  27.08 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0244  putative lipoprotein  26.16 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.482265  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4389  phosphoserine phosphatase  25.2 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5319  hypothetical protein  25.79 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0878389  normal  0.0141688 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3400  twin-arginine translocation pathway signal  25.4 
 
 		 527 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4908  phosphoserine phosphatase  25.2 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.433606 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4967  hypothetical protein  25.4 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139442  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7058  hypothetical protein  25.49 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.291657 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1041  phosphoserine phosphatase  24.7 
 
 		 519 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0878  hypothetical protein  24.7 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0881  hypothetical protein  24.3 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0338  hypothetical protein  24.3 
 
 		 519 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.249122  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0637  hypothetical protein  24.3 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0085  hypothetical protein  24.3 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712977  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2471  hypothetical protein  24.3 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0283788  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0700  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  24.1 
 
 		 476 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8503  hypothetical protein  23.65 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287647  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0094  hypothetical protein  23.41 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000042098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3280  hypothetical protein  26.98 
 
 		 422 aa  49.7  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.439147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>