36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3280 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3280  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  868    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.439147  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0244  putative lipoprotein  42.09 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.482265  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3340  hypothetical protein  44.17 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8503  hypothetical protein  43.85 
 
 		 433 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287647  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5319  hypothetical protein  36.13 
 
 		 425 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0878389  normal  0.0141688 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4967  hypothetical protein  36.13 
 
 		 425 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139442  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7058  hypothetical protein  36.92 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.291657 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3400  twin-arginine translocation pathway signal  36.13 
 
 		 527 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4908  phosphoserine phosphatase  35.81 
 
 		 425 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.433606 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0338  hypothetical protein  38.21 
 
 		 519 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.249122  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0085  hypothetical protein  38.21 
 
 		 517 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712977  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0881  hypothetical protein  38.21 
 
 		 433 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4389  phosphoserine phosphatase  35.58 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2471  hypothetical protein  38.21 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0283788  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0637  hypothetical protein  38.21 
 
 		 517 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0878  hypothetical protein  37.97 
 
 		 433 aa  289  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717121  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1041  phosphoserine phosphatase  37.97 
 
 		 519 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0700  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  37.69 
 
 		 476 aa  285  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0094  hypothetical protein  31.36 
 
 		 382 aa  202  8e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000042098  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1977  hypothetical protein  29.97 
 
 		 396 aa  194  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1127  hypothetical protein  26.5 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0528  hypothetical protein  24.66 
 
 		 352 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0552  hypothetical protein  24.66 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2758  hypothetical protein  25.87 
 
 		 352 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6065  phosphorylcholine phosphatase  24.83 
 
 		 349 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0595  hypothetical protein  23.31 
 
 		 352 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.164758 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3709  hypothetical protein  22.64 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43537  normal  0.241243 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0627  hypothetical protein  23.31 
 
 		 352 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112871  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0144  hypothetical protein  23.31 
 
 		 352 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69592  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5130  hypothetical protein  24.08 
 
 		 351 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5003  hypothetical protein  24.08 
 
 		 351 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0243051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5182  hypothetical protein  27.2 
 
 		 351 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69870  phosphorylcholine phosphatase  22.9 
 
 		 349 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0335  hypothetical protein  26.19 
 
 		 351 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4738  hypothetical protein  23.81 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.171999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0436  hypothetical protein  25 
 
 		 352 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>