37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0595 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2758  hypothetical protein  94.6 
 
 
352 aa  695    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0595  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  728    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.164758 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3709  hypothetical protein  97.73 
 
 
352 aa  715    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43537  normal  0.241243 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0627  hypothetical protein  99.43 
 
 
352 aa  724    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112871  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0144  hypothetical protein  99.43 
 
 
352 aa  724    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69592  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0528  hypothetical protein  96.59 
 
 
352 aa  709    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0552  hypothetical protein  96.59 
 
 
352 aa  709    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5359  hypothetical protein  67.07 
 
 
353 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0436  hypothetical protein  62.39 
 
 
352 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4738  hypothetical protein  62.15 
 
 
352 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.171999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6065  phosphorylcholine phosphatase  61.6 
 
 
349 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5003  hypothetical protein  59.37 
 
 
351 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0243051  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5130  hypothetical protein  59.65 
 
 
351 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69870  phosphorylcholine phosphatase  63.55 
 
 
349 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5182  hypothetical protein  58.57 
 
 
351 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0335  hypothetical protein  59.13 
 
 
351 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5319  hypothetical protein  25.2 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0878389  normal  0.0141688 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3400  twin-arginine translocation pathway signal  24.93 
 
 
527 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4967  hypothetical protein  24.93 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139442  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4389  phosphoserine phosphatase  25.82 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4908  phosphoserine phosphatase  24.73 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.433606 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1977  hypothetical protein  33.55 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7058  hypothetical protein  25.82 
 
 
424 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.291657 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3340  hypothetical protein  28.76 
 
 
424 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0244  putative lipoprotein  25.07 
 
 
440 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.482265  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0881  hypothetical protein  23.58 
 
 
433 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0878  hypothetical protein  23.58 
 
 
433 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717121  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1041  phosphoserine phosphatase  23.58 
 
 
519 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0700  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  24.1 
 
 
476 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0085  hypothetical protein  23.32 
 
 
517 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712977  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2471  hypothetical protein  23.32 
 
 
433 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0283788  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0637  hypothetical protein  23.32 
 
 
517 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210974  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8503  hypothetical protein  23.71 
 
 
433 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287647  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0338  hypothetical protein  23.32 
 
 
519 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.249122  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3280  hypothetical protein  26.72 
 
 
422 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.439147  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0094  hypothetical protein  22.26 
 
 
382 aa  46.6  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000042098  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1127  hypothetical protein  21.74 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>