38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0244 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0244  putative lipoprotein  100 
 
 		 440 aa  889    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.482265  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3340  hypothetical protein  58.38 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3280  hypothetical protein  45.5 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.439147  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8503  hypothetical protein  43.32 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287647  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3400  twin-arginine translocation pathway signal  42.27 
 
 		 527 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4967  hypothetical protein  42.16 
 
 		 425 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139442  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4908  phosphoserine phosphatase  42.27 
 
 		 425 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.433606 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5319  hypothetical protein  41.9 
 
 		 425 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0878389  normal  0.0141688 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4389  phosphoserine phosphatase  42.27 
 
 		 425 aa  328  8e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7058  hypothetical protein  41.75 
 
 		 424 aa  326  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.291657 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0878  hypothetical protein  40.93 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717121  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0338  hypothetical protein  39.8 
 
 		 519 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.249122  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1041  phosphoserine phosphatase  40.93 
 
 		 519 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0881  hypothetical protein  40.93 
 
 		 433 aa  323  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0637  hypothetical protein  39.8 
 
 		 517 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210974  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2471  hypothetical protein  40.93 
 
 		 433 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0283788  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0085  hypothetical protein  39.8 
 
 		 517 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712977  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0700  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  39.9 
 
 		 476 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0094  hypothetical protein  38.89 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000042098  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1977  hypothetical protein  39.52 
 
 		 396 aa  252  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1127  hypothetical protein  32.01 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0335  hypothetical protein  28.19 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6065  phosphorylcholine phosphatase  27.73 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5130  hypothetical protein  26.43 
 
 		 351 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5003  hypothetical protein  26.16 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0243051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69870  phosphorylcholine phosphatase  26.41 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5182  hypothetical protein  27.3 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4738  hypothetical protein  27.89 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.171999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5359  hypothetical protein  27.7 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0436  hypothetical protein  27.89 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0528  hypothetical protein  25.42 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0552  hypothetical protein  25.42 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2758  hypothetical protein  24.86 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3709  hypothetical protein  25.36 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43537  normal  0.241243 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0144  hypothetical protein  25.07 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0595  hypothetical protein  25.07 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.164758 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0627  hypothetical protein  25.07 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112871  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11950  lipoprotein lppF  21.39 
 
 		 423 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>