49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3597 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3597  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4072  hypothetical protein  94.81 
 
 		 231 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0689  hypothetical protein  55.32 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3065  hypothetical protein  50.19 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0926  hypothetical protein  52.61 
 
 		 248 aa  208  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3683  hypothetical protein  53.77 
 
 		 200 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4760  hypothetical protein  53.77 
 
 		 200 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00298673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00799  hypothetical protein  55.05 
 
 		 195 aa  191  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  41.21 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3674  hypothetical protein  45.45 
 
 		 245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0654839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0352  hypothetical protein  45.45 
 
 		 245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0349  hypothetical protein  43.92 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.849457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0448  hypothetical protein  44.59 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0344  hypothetical protein  42.95 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0352  hypothetical protein  42.95 
 
 		 244 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000422268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0342  hypothetical protein  42.95 
 
 		 244 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0346  hypothetical protein  45.45 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00594188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0327  hypothetical protein  43.23 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4594  hypothetical protein  44.14 
 
 		 242 aa  122  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4366  hypothetical protein  45.32 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3509  hypothetical protein  39.88 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.243823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3886  hypothetical protein  43.66 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.707997  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3377  hypothetical protein  41.94 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  40.76 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2105  hypothetical protein  40.13 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3873  hypothetical protein  41.59 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.451161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5091  hypothetical protein  40.14 
 
 		 239 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004062  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  37.42 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0439  hypothetical protein  40.14 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3925  hypothetical protein  39.31 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4376  hypothetical protein  39.31 
 
 		 286 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0109  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1486  hypothetical protein  33.17 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1316  hypothetical protein  43.14 
 
 		 283 aa  78.2  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0233614  hitchhiker  0.0084742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  31.68 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1160  hypothetical protein  29.61 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000752472  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4567  hypothetical protein  31.47 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  28.04 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2748  hypothetical protein  33.57 
 
 		 237 aa  62  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3985  hypothetical protein  36.22 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0439  hypothetical protein  26.72 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0815412  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3993  hypothetical protein  28.8 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2171  hypothetical protein  29.53 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1325  hypothetical protein  31.07 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0146355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  34.91 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0474  hypothetical protein  41.07 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.985859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2240  hypothetical protein  35.03 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0925  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  33.33 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2122  hypothetical protein  29.52 
 
 		 213 aa  42  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>