200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1444 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1444  cytochrome B561  100 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4238  cytochrome B561  42.01 
 
 		 176 aa  148  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.295562 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04738  cytochrome b561  40.91 
 
 		 195 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0135  putative cytochrome b561  36.75 
 
 		 179 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.81104  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  28.26 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  30.46 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05609  hypothetical protein  48.08 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  30.5 
 
 		 199 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  30.5 
 
 		 222 aa  72  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  28.18 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  30.48 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  30.48 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.48 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  29.95 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  29.95 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  29.95 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  29.95 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  30.41 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  27.43 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  30.46 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  29.67 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  30.3 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  29.71 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  30.46 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  29.41 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  26.49 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  28.65 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  26.55 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  28.32 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1418  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  28.14 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  29.51 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  30.46 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  30.51 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  27.53 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  30.3 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  27.12 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  26.26 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  30 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  27.49 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  27.53 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  30.77 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  28.65 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  29.89 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  29.7 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  28.65 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  29.51 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  27.91 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  25.99 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  27.27 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  28.4 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  28.65 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  28.07 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  28.24 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  28.65 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  30.68 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  28.16 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  30.68 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  27.33 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  26.4 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  31.07 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  27.88 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  27.91 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  29.31 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  30.46 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  28.31 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  28.11 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  27.33 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  29.48 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  30.11 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  26.16 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  27.91 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  28.9 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  25.86 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  31.43 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  25.29 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  27.88 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  27.88 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  30.46 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  27.91 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0583  cytochrome B561  27.47 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  27.72 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  30.59 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  34.1 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  30 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  26.44 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  28.16 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  27.06 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  26.63 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  27.47 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  27.27 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  27.33 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  26.74 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  24.71 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  29.41 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  25.43 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  25.57 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  27.27 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  26.01 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  26.84 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  27.33 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>