53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0136 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  95.83 
 
 		 240 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  92.52 
 
 		 235 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  92.06 
 
 		 235 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  92.06 
 
 		 235 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  91.12 
 
 		 235 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  73.36 
 
 		 267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  73.36 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  73.36 
 
 		 244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  73.36 
 
 		 244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  73.36 
 
 		 244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  71.96 
 
 		 258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  72.9 
 
 		 267 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.78 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3142  hypothetical protein  50.93 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.917118  normal  0.0747759 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  44.1 
 
 		 242 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3261  hypothetical protein  42.73 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2055  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  41.57 
 
 		 264 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1908  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.11 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000035223  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  41.59 
 
 		 225 aa  141  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2206  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.54 
 
 		 280 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0148894  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  38.4 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1538  hypothetical protein  69.47 
 
 		 125 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.313345  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  32.79 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4028  hypothetical protein  41.81 
 
 		 280 aa  132  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1915  hypothetical protein  32.14 
 
 		 280 aa  131  7.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000228464  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1537  hypothetical protein  78.05 
 
 		 82 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01055  hypothetical protein  42.56 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  37.96 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1368  hypothetical protein  37.5 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15910  hypothetical protein  36.45 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  40.29 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  31.19 
 
 		 343 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  30.51 
 
 		 351 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  30.92 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  34.02 
 
 		 314 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  34.24 
 
 		 348 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  30.25 
 
 		 305 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  31.89 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  32.57 
 
 		 361 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  32.09 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  32.11 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  29.73 
 
 		 320 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  28.73 
 
 		 347 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  30.19 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  32.57 
 
 		 361 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  27.56 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.41 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  35.43 
 
 		 348 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  31.07 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  31.31 
 
 		 340 aa  42  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1032  lysophospholipase  25.77 
 
 		 223 aa  42  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>