More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6580 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6580  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 341 aa  696    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0128065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3762  putative transposase  92.35 
 
 		 341 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.915156 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2913  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  67.66 
 
 		 339 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0485  putative transposase IS116/IS110/IS902  65.53 
 
 		 332 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0324291  normal  0.781699 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3882  transposase, IS1111 family  60.48 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2240  transposase, IS1111 family  60.48 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000963569  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18390  Transposase IS116/IS110/IS902 family  54.55 
 
 		 341 aa  364  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3183  ISAfe1, transposase  52.2 
 
 		 342 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487441  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1895  ISAfe1, transposase  52.2 
 
 		 342 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2781  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.2 
 
 		 342 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.2 
 
 		 342 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1569  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.2 
 
 		 342 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196029 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6180  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.45 
 
 		 336 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.626192  hitchhiker  0.00140825 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0427  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 346 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1747  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 346 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1396  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 346 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.199671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4127  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  61.48 
 
 		 253 aa  307  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.177688  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.43 
 
 		 347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.82 
 
 		 499 aa  305  8.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.82 
 
 		 344 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.66 
 
 		 346 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.51 
 
 		 343 aa  291  8e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.51 
 
 		 343 aa  291  8e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  41.19 
 
 		 341 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  43.73 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  40.9 
 
 		 341 aa  268  8e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  43.58 
 
 		 338 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  43.58 
 
 		 338 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  43.58 
 
 		 338 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  42.86 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  43.28 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  43.28 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  43.28 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.41 
 
 		 338 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.77 
 
 		 338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.71 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  40.12 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  40.12 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  40.12 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  40.12 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.11 
 
 		 341 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.11 
 
 		 341 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  42.39 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.42 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.52 
 
 		 338 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.52 
 
 		 338 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.52 
 
 		 338 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.52 
 
 		 338 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.52 
 
 		 338 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.52 
 
 		 338 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.52 
 
 		 338 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.52 
 
 		 338 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.27 
 
 		 348 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  43.27 
 
 		 348 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0943  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.48 
 
 		 338 aa  245  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.48 
 
 		 338 aa  245  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.4 
 
 		 342 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  39.7 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  40.3 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  43.25 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  40.3 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  40.3 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  40.3 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  40.3 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  40.3 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  40.3 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  41.92 
 
 		 340 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.53 
 
 		 311 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7434  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.85 
 
 		 275 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.57 
 
 		 345 aa  236  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2485  ISPsy7, transposase  42.18 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00294179  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  39.94 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  39.76 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.62 
 
 		 338 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2465  ISPsy7, transposase  41.89 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3274  ISPsy7, transposase  41.89 
 
 		 340 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0336107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0372  ISPsy7, transposase  41.89 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2167  ISPsy7, transposase  41.89 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3146  ISPsy7, transposase  41.89 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0791519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3325  ISPsy7, transposase  41.89 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0495526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3746  ISPsy7, transposase  41.89 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3800  ISPsy7, transposase  41.89 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5571  ISPsy7, transposase  41.89 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0345  transposase IS116/IS110/IS902  39.37 
 
 		 343 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.211948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1921  transposase IS116/IS110/IS902  39.37 
 
 		 343 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3076  transposase IS116/IS110/IS902  39.37 
 
 		 343 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  40.71 
 
 		 342 aa  231  9e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  40.71 
 
 		 342 aa  231  9e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.7 
 
 		 350 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  42.91 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  42.3 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2447  transposase IS116/IS110/IS902  39.37 
 
 		 343 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3074  transposase IS116/IS110/IS902  39.37 
 
 		 343 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.18 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.18 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>