More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4633 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4633  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 322 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal  0.676677 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5702  LysR family transcriptional regulator  56.31 
 
 		 320 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0313513 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0872  LysR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0596  LysR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1839  LysR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1112  LysR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2329  LysR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 354 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1646  LysR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1025  LysR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 336 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951762  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4540  LysR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29008  normal  0.0118827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4343  LysR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3828  LysR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224143  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3964  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 322 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0669221  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5764  LysR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 322 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5836  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 329 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5024  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 329 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205227  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3043  LysR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 327 aa  205  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.696334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4120  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1305  LysR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1394  LysR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 430 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3740  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4426  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 322 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0435  LysR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1196  LysR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191376  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0157  LysR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820068  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1142  LysR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1489  LysR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1404  LysR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4325  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0008  transcriptional regulator  40.19 
 
 		 431 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636727  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4214  LysR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.383155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3196  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  38.69 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4041  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0750  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.63163  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0936  transcriptional regulator  38.11 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434313  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1855  transcriptional regulator  38.11 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1679  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1469  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1701  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0412  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4285  LysR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.300927 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1681  LysR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446962  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  37.79 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  39.34 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5752  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.515576 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5327  LysR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 317 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0620404 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6200  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0503075 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6676  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454387  normal  0.341133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0937  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6527  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5996  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.48899 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5833  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5074  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1262  LysR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.902208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4461  LysR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4584  LysR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 318 aa  192  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4278  LysR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0865  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1210  putative transcriptional regulator  37.9 
 
 		 317 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13510  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0430  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.716475 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1216  transcriptional regulator, LysR family  36.93 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4638  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 314 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2420  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 334 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259227 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2931  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 352 aa  186  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4797  transcriptional regulator, LysR family  35.78 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0282773  hitchhiker  0.00000720419 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2962  LysR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52930  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1044  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.93 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.865685  normal  0.351691 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3189  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4971  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2804  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 308 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0155  LysR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0458494  normal  0.226334 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4290  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 328 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2877  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 320 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2967  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2987  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2353  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884603  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6316  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3014  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 320 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1864  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 331 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708451  normal  0.0358907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0237  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 355 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0344  LysR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 320 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0535  LysR family regulatory protein  37.38 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.077291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0356  LysR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.681005  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0306  LysR family regulatory protein  37.07 
 
 		 320 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489462  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27400  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 323 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3585  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  37.79 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>