39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3837 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3837  dimethylargininase  100 
 
 
252 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456176  normal  0.996067 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3320  dimethylargininase  99.6 
 
 
256 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2143  dimethylargininase  94.84 
 
 
256 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434845  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4424  dimethylargininase  94.44 
 
 
256 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3585  dimethylargininase  94.44 
 
 
256 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849367  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3943  dimethylargininase  94.44 
 
 
256 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444932  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4639  amidinotransferase  90.48 
 
 
252 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266629  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  57.71 
 
 
253 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  54.98 
 
 
257 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  48.24 
 
 
256 aa  234  8e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  46.48 
 
 
258 aa  219  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  45.14 
 
 
263 aa  218  1e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  41.8 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1628  hypothetical protein  42.13 
 
 
255 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1622  hypothetical protein  41.73 
 
 
255 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  42.19 
 
 
254 aa  198  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  42.19 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  40.86 
 
 
261 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4635  amidinotransferase  37.8 
 
 
264 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.370008 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  34.27 
 
 
258 aa  148  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1658  Dimethylargininase  38.34 
 
 
262 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63661  normal  0.0320201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  38.52 
 
 
257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1192  endoribonuclease L-PSP  31.98 
 
 
387 aa  108  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3241  Dimethylargininase  35.66 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4475  endoribonuclease L-PSP  29.74 
 
 
368 aa  89  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  25.76 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0329  amidinotransferase family protein  22.47 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  24.68 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  23.79 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  24.17 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0130  amidinotransferase  26.85 
 
 
268 aa  52.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  23.68 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2672  amidinotransferase  24.79 
 
 
296 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6526  putative amidinotransferase family protein  30.41 
 
 
333 aa  48.9  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1759  amidinotransferase  27.2 
 
 
320 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3467  amidinotransferase  25.91 
 
 
294 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.501017  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0585  amidinotransferase  25.51 
 
 
292 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4521  amidinotransferase  26.83 
 
 
287 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0453  amidinotransferase  23.5 
 
 
279 aa  43.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166592  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>