40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1457 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1457  putative lipoprotein  100 
 
 
419 aa  828    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0434  putative lipoprotein  99.26 
 
 
421 aa  707    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1808  putative lipoprotein  99.26 
 
 
420 aa  707    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00934071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1320  putative lipoprotein  99.05 
 
 
420 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1311  putative lipoprotein  98.57 
 
 
420 aa  813    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0716  putative lipoprotein  99.26 
 
 
421 aa  707    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1151  putative lipoprotein  99.26 
 
 
421 aa  707    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.403494  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2293  parallel beta-helix repeat-containing protein  62.8 
 
 
372 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2429  parallel beta-helix repeat-containing protein  62.26 
 
 
372 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0792  hypothetical protein  62.8 
 
 
431 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.992362  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3715  parallel beta-helix repeat-containing protein  58.4 
 
 
563 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4103  hypothetical protein  53.66 
 
 
424 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1813  hypothetical protein  57.68 
 
 
429 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.679097  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3628  hypothetical protein  53.66 
 
 
424 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174026  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4400  hypothetical protein  50.83 
 
 
423 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0913462  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1082  putative lipoprotein  69.92 
 
 
145 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1348  hypothetical protein  34.58 
 
 
364 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1329  hypothetical protein  34.81 
 
 
376 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1312  hypothetical protein  34.81 
 
 
359 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7522  hypothetical protein  27.39 
 
 
807 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.856232  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  25.95 
 
 
675 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  25.67 
 
 
671 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1718  hypothetical protein  35.25 
 
 
508 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.586514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.35 
 
 
1448 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.27 
 
 
1212 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.91 
 
 
1410 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  27.84 
 
 
1213 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.3 
 
 
823 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.5 
 
 
584 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3586  hypothetical protein  30.29 
 
 
784 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  24.39 
 
 
1085 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2243  nitrous oxidase accessory protein  24.64 
 
 
455 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.685019  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.48 
 
 
1109 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3654  hypothetical protein  26.43 
 
 
791 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  27.17 
 
 
1000 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3581  hypothetical protein  26.43 
 
 
791 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  26.97 
 
 
1091 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2646  nitrous oxidase accessory protein  25.59 
 
 
455 aa  44.3  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696953  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  24.21 
 
 
1418 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  24.37 
 
 
509 aa  43.5  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.875896 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>