29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3242 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  671    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  50.46 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  48.01 
 
 		 316 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  48.78 
 
 		 320 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4818  TIR protein  39.94 
 
 		 327 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  52.8 
 
 		 584 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6204  TIR protein  35.12 
 
 		 260 aa  168  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.396579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  54.61 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  45.83 
 
 		 942 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3816  hypothetical protein  55.2 
 
 		 135 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000096587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1920  TIR protein  40.71 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0088  TIR protein  35.85 
 
 		 245 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5406  TIR protein  33.73 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3815  hypothetical protein  42.86 
 
 		 364 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00546269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  39.01 
 
 		 851 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1477  TIR protein  33.33 
 
 		 183 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.475025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  27.69 
 
 		 585 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  28.23 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  30.14 
 
 		 552 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  29.45 
 
 		 552 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0273  TIR protein  27.46 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  33.33 
 
 		 1348 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0269  hypothetical protein  30.53 
 
 		 195 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.108769  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  34.78 
 
 		 544 aa  50.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  28.42 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  32.41 
 
 		 1048 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  30.56 
 
 		 1363 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  32 
 
 		 286 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  25.93 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>