More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0076 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0076  stage 0 sporulation protein J, putative  100 
 
 
213 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014387  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0027  parB-like partition protein  84.16 
 
 
300 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1191  hypothetical protein  70.15 
 
 
299 aa  291  5e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0188  hypothetical protein  70.15 
 
 
299 aa  291  5e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0905947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2983  putative ParB-like partioning protein  67.16 
 
 
299 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3173  parB-like partition protein  64.85 
 
 
303 aa  270  8.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0831  parB-like partition protein  51.49 
 
 
288 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1403  parB-like partition protein  50.99 
 
 
288 aa  192  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4808  nuclease  49.75 
 
 
306 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0527  ParB family protein  51.01 
 
 
299 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3813  ParB-like nuclease  47.55 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.112048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0033  ParB family protein  44.95 
 
 
301 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3502  RepB plasmid partition  47.06 
 
 
302 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.884798  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0771  ParB family protein  44.61 
 
 
296 aa  164  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02511  ParB family protein  41.38 
 
 
298 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02475  hypothetical protein  41.38 
 
 
298 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2907  ParB family protein  41.38 
 
 
298 aa  142  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2889  nuclease  40.61 
 
 
298 aa  138  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.232082  normal  0.662657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2747  stage 0 sporulation protein J, putative  40.91 
 
 
136 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  36.43 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  37.82 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  37.82 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  37.82 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  37.82 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  37.82 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  37.82 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  37.82 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  37.82 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  37.82 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  37.82 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  37.82 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  34.75 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  36.43 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  36.43 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  36.97 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  32.64 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  35.17 
 
 
303 aa  72  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  32.93 
 
 
302 aa  72  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  34.29 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  35.38 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  33.33 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  33.85 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  34.07 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  41.41 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  37.19 
 
 
297 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  34.11 
 
 
311 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  33.81 
 
 
311 aa  68.2  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  32.31 
 
 
304 aa  68.2  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  37.84 
 
 
305 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  37.19 
 
 
297 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  35 
 
 
324 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  40.45 
 
 
529 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  35.1 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  32.67 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  35.21 
 
 
323 aa  65.5  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  32.8 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  31.21 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  30.13 
 
 
283 aa  65.5  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  34.04 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  34.31 
 
 
290 aa  64.3  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  34.19 
 
 
284 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  28.65 
 
 
280 aa  64.3  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0050  parB-like partition protein  34.06 
 
 
315 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 
330 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  28.66 
 
 
288 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 
330 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  35.38 
 
 
290 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 
330 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  34.4 
 
 
290 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  32 
 
 
274 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  28.57 
 
 
294 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  34.31 
 
 
288 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  31.2 
 
 
290 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  35.14 
 
 
341 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  33.86 
 
 
281 aa  63.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  31.2 
 
 
290 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  31.2 
 
 
290 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  33.83 
 
 
323 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  34.4 
 
 
290 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  29.17 
 
 
305 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6576  parB-like partition protein  34.29 
 
 
324 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152198  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  31.25 
 
 
257 aa  62.8  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  30.32 
 
 
290 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  35.09 
 
 
286 aa  62.8  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  34.75 
 
 
344 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  30.32 
 
 
290 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  30.77 
 
 
289 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1396  parB-like partition protein  32.35 
 
 
362 aa  62.4  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0186141  hitchhiker  0.0000927483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  34.15 
 
 
306 aa  62.4  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  35.14 
 
 
597 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  34.04 
 
 
286 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  29.33 
 
 
255 aa  62  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  40 
 
 
331 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  33.9 
 
 
291 aa  61.6  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  33.1 
 
 
280 aa  61.6  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  32.65 
 
 
314 aa  61.6  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  29.61 
 
 
304 aa  61.6  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2805  chromosome segregation DNA-binding protein  34.71 
 
 
284 aa  61.6  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.012977  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  32.43 
 
 
319 aa  61.6  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3930  parB-like partition protein  35.07 
 
 
438 aa  61.6  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000021356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>