29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1454 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1454  protein-disulfide isomerase  100 
 
 
324 aa  671    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0066  hypothetical protein  38.85 
 
 
323 aa  215  7e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0355055 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  36.54 
 
 
319 aa  206  5e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  26.71 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  24.25 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  25 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  28.12 
 
 
252 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  28.12 
 
 
252 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  28.12 
 
 
252 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  22.69 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  27.7 
 
 
255 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  26.91 
 
 
276 aa  63.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  28.83 
 
 
307 aa  62.8  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  25.57 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  24.91 
 
 
316 aa  59.7  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  33.64 
 
 
566 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  26.56 
 
 
277 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  32.74 
 
 
248 aa  57  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  22.4 
 
 
264 aa  53.9  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  21.88 
 
 
279 aa  52.8  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  24.54 
 
 
246 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  24.04 
 
 
291 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  21.84 
 
 
237 aa  49.3  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  26.79 
 
 
248 aa  46.6  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  25.68 
 
 
192 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 
238 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 
275 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  35.42 
 
 
270 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  23.76 
 
 
312 aa  42.7  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>