34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7256 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7256  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  172  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4536  type IV pilus assembly PilZ  57.69 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  55.56 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  51.9 
 
 		 79 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  50 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  45.57 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  45.57 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  45.12 
 
 		 83 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4663  hypothetical protein  37.04 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969031  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  40.79 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1244  type IV pilus assembly PilZ  48.28 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1467  hypothetical protein  35.53 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2644  hypothetical protein  35.9 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  37.84 
 
 		 417 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3181  type IV pilus assembly PilZ  30.77 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4372  type IV pilus assembly PilZ  32.89 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  37.84 
 
 		 417 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7098  type IV pilus assembly PilZ  34.18 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.867442  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  37.8 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3553  type IV pilus assembly PilZ  35 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  34.62 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  33.75 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5314  type IV pilus assembly PilZ  28.05 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.947891  normal  0.173027 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  31.25 
 
 		 86 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3320  type IV pilus assembly PilZ  32.93 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5566  hypothetical protein  38.1 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  32.05 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0833  type IV pilus assembly PilZ  26.92 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2495  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3050  type IV pilus assembly PilZ  30.77 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2400  hypothetical protein  34.33 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  31.25 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1603  hypothetical protein  42.59 
 
 		 118 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4006  type IV pilus assembly PilZ  30.77 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0788285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4529  type IV pilus assembly PilZ  30.86 
 
 		 99 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.470833  normal  0.812633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>