54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6284 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6284  putative periplasmic-binding protein  100 
 
 		 265 aa  537  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1297  extracellular solute-binding protein  35.27 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2646  extracellular solute-binding protein  31.05 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.997273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0285  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.994895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4109  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 264 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.664204  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4313  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.438014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45195  predicted protein  25.43 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3455  putative amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  25.71 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04698  periplasmic substrate binding ABC transporter protein  27.43 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3636  extracellular solute-binding protein family 3  29.47 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.59453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1628  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4744  extracellular solute-binding protein family 3  28.51 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273902  normal  0.741652 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5653  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2836  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1361  extracellular solute-binding protein  20.98 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0588  extracellular solute-binding protein family 3  21.21 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3154  extracellular solute-binding protein family 3  24.36 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0903537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3873  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.543903  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4651  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545523  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3717  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4553  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 294 aa  52.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8634  extracellular solute-binding protein family 3  22.17 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0308  periplasmic binding protein from ABC-type transporter  36.59 
 
 		 162 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0940761 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  26.89 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5064  hypothetical protein  32.41 
 
 		 162 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  25.17 
 
 		 286 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5157  hypothetical protein  32.98 
 
 		 162 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.809512 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  25.17 
 
 		 281 aa  48.9  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  27.27 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.37 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  23.39 
 
 		 502 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.57 
 
 		 276 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5210  hypothetical protein  30.85 
 
 		 163 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.57 
 
 		 276 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0782  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  26.57 
 
 		 276 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.57 
 
 		 276 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2694  extracellular solute-binding protein family 3  31.22 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7267  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  22.8 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0092  Transaldolase  34.18 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0864  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0237  extracellular solute-binding protein family 3  23.94 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.640745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5977  extracellular solute-binding protein  21.83 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0043  cyclohexadienyl dehydratase  23.68 
 
 		 265 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4307  family 1 extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 292 aa  42  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>