251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4402 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4402  putative dioxygenase  100 
 
 		 228 aa  463  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278227  normal  0.115842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  37.18 
 
 		 296 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  30.34 
 
 		 285 aa  104  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  32.51 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  30.13 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  29.41 
 
 		 264 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  31.2 
 
 		 299 aa  95.1  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2171  TauD/TfdA family dioxygenase  33.75 
 
 		 292 aa  95.1  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0808968  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0816  TauD/TfdA family dioxygenase  33.75 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0908  TauD/TfdA family dioxygenase  33.75 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0747691  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  28.68 
 
 		 287 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  29.84 
 
 		 308 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  29.89 
 
 		 291 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.57 
 
 		 298 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  30.54 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  27.24 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  27.74 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  26.69 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  27.44 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  28.57 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  26.45 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  29.23 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  29.23 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  27.57 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  28.35 
 
 		 308 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  28.35 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  28.24 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2123  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.03 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  31.15 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  31.15 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  28.52 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  27.44 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  27.76 
 
 		 273 aa  75.1  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  28.41 
 
 		 315 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  25.67 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  26.42 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  30.17 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  26.84 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.46 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  26.04 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  30.36 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  25.28 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  28.03 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  25.28 
 
 		 283 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  28.35 
 
 		 315 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.09 
 
 		 288 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  25.28 
 
 		 283 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  25.28 
 
 		 283 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  25.28 
 
 		 283 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  25.28 
 
 		 283 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  25.28 
 
 		 283 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  25.28 
 
 		 283 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  25 
 
 		 306 aa  71.6  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3086  taurine dioxygenase  27.65 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.042255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  29.76 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  22.78 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  35.71 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1161  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00427132  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  29.13 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  26.42 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  27.48 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  27.48 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  25.29 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  27.48 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  29.13 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  26.32 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  27.7 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  27.69 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  29.18 
 
 		 309 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  29.13 
 
 		 315 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  24.42 
 
 		 298 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3279  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  27.07 
 
 		 312 aa  68.2  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  28.97 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  29.92 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  25.18 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3261  taurine dioxygenase  34.75 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000698237  hitchhiker  0.000951887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2528  taurine dioxygenase  28.85 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2491  taurine dioxygenase  28.85 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2536  taurine dioxygenase  28.85 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.2 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  28.17 
 
 		 277 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  25.29 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6394  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.9 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3703  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.93 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6627  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.9 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  26.19 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  26.19 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  26.19 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3721  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.74 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  24.8 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  26.64 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  26.19 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  26.19 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  26.19 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  25.49 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  22.79 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3708  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.74 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3781  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.74 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485514  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  26.19 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  25.79 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>