46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2605 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  34.67 
 
 		 1649 aa  657    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2605  hypothetical protein  100 
 
 		 1680 aa  3353    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1299  hypothetical protein  43.84 
 
 		 1763 aa  936    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  36.06 
 
 		 1629 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  28.16 
 
 		 1697 aa  371  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1652 aa  369  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4085  hypothetical protein  39.48 
 
 		 553 aa  185  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.414268  normal  0.0981997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1331  hypothetical protein  37.18 
 
 		 540 aa  184  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4773  hypothetical protein  39.38 
 
 		 534 aa  178  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43696  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1124  hypothetical protein  38.89 
 
 		 518 aa  177  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2964  hypothetical protein  43.78 
 
 		 540 aa  176  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1851  hypothetical protein  48.6 
 
 		 546 aa  173  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3893  hypothetical protein  44.75 
 
 		 541 aa  169  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0724599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1474 aa  156  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  41.71 
 
 		 472 aa  143  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1724 aa  137  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  26.71 
 
 		 1523 aa  134  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0036  hypothetical protein  37.36 
 
 		 460 aa  120  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3157  hypothetical protein  33.17 
 
 		 544 aa  109  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0907045  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3345  hypothetical protein  36.13 
 
 		 841 aa  107  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172568  decreased coverage  0.00479246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3088  hypothetical protein  35.48 
 
 		 836 aa  106  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671976  normal  0.139652 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2615  hypothetical protein  34.83 
 
 		 766 aa  105  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  27.4 
 
 		 1557 aa  103  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7582  hypothetical protein  34.83 
 
 		 409 aa  101  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117835  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1625  hypothetical protein  31.91 
 
 		 465 aa  99.8  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1681  hypothetical protein  31.91 
 
 		 465 aa  99.8  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571535  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3542  hypothetical protein  31.4 
 
 		 715 aa  95.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652953  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0941  hypothetical protein  31.18 
 
 		 493 aa  93.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  22.76 
 
 		 1790 aa  91.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1000  hypothetical protein  31.07 
 
 		 492 aa  90.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6846  hypothetical protein  32.02 
 
 		 414 aa  90.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  23.99 
 
 		 1630 aa  90.5  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0963  hypothetical protein  31.07 
 
 		 493 aa  90.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.373348 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1006  hypothetical protein  28.92 
 
 		 634 aa  89.4  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0103184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5639  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 496 aa  89  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  0.277349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1232  hypothetical protein  29.13 
 
 		 479 aa  87.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  24.45 
 
 		 1490 aa  86.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  23.3 
 
 		 1622 aa  83.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0286  hypothetical protein  27.04 
 
 		 499 aa  72.8  0.00000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  39.29 
 
 		 1489 aa  71.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  34.29 
 
 		 1694 aa  68.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  31.52 
 
 		 1387 aa  65.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  35.34 
 
 		 1575 aa  65.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  34.92 
 
 		 2622 aa  63.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  31.39 
 
 		 1410 aa  61.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  28.97 
 
 		 1945 aa  47  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>