29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1331 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1331  hypothetical protein  100 
 
 		 540 aa  1055    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4085  hypothetical protein  67.9 
 
 		 553 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.414268  normal  0.0981997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3893  hypothetical protein  85.64 
 
 		 541 aa  834    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0724599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4773  hypothetical protein  77.39 
 
 		 534 aa  741    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43696  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1124  hypothetical protein  63.45 
 
 		 518 aa  610  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1851  hypothetical protein  61.77 
 
 		 546 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2964  hypothetical protein  69.74 
 
 		 540 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  65.71 
 
 		 472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0036  hypothetical protein  46.78 
 
 		 460 aa  191  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2605  hypothetical protein  36.22 
 
 		 1680 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3157  hypothetical protein  45.36 
 
 		 544 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0907045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1299  hypothetical protein  44.29 
 
 		 1763 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1625  hypothetical protein  36.74 
 
 		 465 aa  150  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1681  hypothetical protein  36.74 
 
 		 465 aa  150  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571535  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0963  hypothetical protein  39.23 
 
 		 493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.373348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1000  hypothetical protein  39.23 
 
 		 492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1232  hypothetical protein  39.71 
 
 		 479 aa  147  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2615  hypothetical protein  36.49 
 
 		 766 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3088  hypothetical protein  37.14 
 
 		 836 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671976  normal  0.139652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3345  hypothetical protein  38.2 
 
 		 841 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172568  decreased coverage  0.00479246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0941  hypothetical protein  34.74 
 
 		 493 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3542  hypothetical protein  36.16 
 
 		 715 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652953  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1006  hypothetical protein  37.56 
 
 		 634 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0103184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7582  hypothetical protein  35.45 
 
 		 409 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6846  hypothetical protein  41.9 
 
 		 414 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5639  putative CheA signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 496 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  0.277349 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0286  hypothetical protein  28.01 
 
 		 499 aa  110  9.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  42.65 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  30.3 
 
 		 2179 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>