29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5639 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5639  putative CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
496 aa  955    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  0.277349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1000  hypothetical protein  52.11 
 
 
492 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0963  hypothetical protein  51.58 
 
 
493 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.373348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0941  hypothetical protein  57.48 
 
 
493 aa  300  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7582  hypothetical protein  51.71 
 
 
409 aa  279  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6846  hypothetical protein  48.82 
 
 
414 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1006  hypothetical protein  34.92 
 
 
634 aa  153  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0103184 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4085  hypothetical protein  33.88 
 
 
553 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.414268  normal  0.0981997 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1124  hypothetical protein  42.86 
 
 
518 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1851  hypothetical protein  42.31 
 
 
546 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4773  hypothetical protein  33.45 
 
 
534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43696  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1331  hypothetical protein  39.58 
 
 
540 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2964  hypothetical protein  40.98 
 
 
540 aa  130  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3157  hypothetical protein  38.07 
 
 
544 aa  130  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0907045  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3893  hypothetical protein  39.89 
 
 
541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0724599  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2615  hypothetical protein  39.15 
 
 
766 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3542  hypothetical protein  36.11 
 
 
715 aa  126  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652953  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1232  hypothetical protein  29.71 
 
 
479 aa  123  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1681  hypothetical protein  30.19 
 
 
465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571535  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1625  hypothetical protein  35.52 
 
 
465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  40.51 
 
 
472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3345  hypothetical protein  34.88 
 
 
841 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172568  decreased coverage  0.00479246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3088  hypothetical protein  33.02 
 
 
836 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671976  normal  0.139652 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0286  hypothetical protein  21.92 
 
 
499 aa  103  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1299  hypothetical protein  33.96 
 
 
1763 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2605  hypothetical protein  33.96 
 
 
1680 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6809  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0036  hypothetical protein  51.14 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  46.05 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  35.96 
 
 
2179 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>