27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3345 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3345  hypothetical protein  100 
 
 
841 aa  1673    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172568  decreased coverage  0.00479246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3088  hypothetical protein  85.95 
 
 
836 aa  1342    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671976  normal  0.139652 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2615  hypothetical protein  45.79 
 
 
766 aa  334  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3542  hypothetical protein  44.94 
 
 
715 aa  318  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652953  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1232  hypothetical protein  37.44 
 
 
479 aa  227  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1625  hypothetical protein  39.11 
 
 
465 aa  218  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1681  hypothetical protein  39.11 
 
 
465 aa  218  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571535  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3157  hypothetical protein  45.13 
 
 
544 aa  206  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0907045  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4773  hypothetical protein  41.62 
 
 
534 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43696  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2964  hypothetical protein  40.88 
 
 
540 aa  153  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1124  hypothetical protein  37.93 
 
 
518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4085  hypothetical protein  38.42 
 
 
553 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.414268  normal  0.0981997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1851  hypothetical protein  37.89 
 
 
546 aa  146  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1331  hypothetical protein  38.8 
 
 
540 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3893  hypothetical protein  38.02 
 
 
541 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0724599  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0286  hypothetical protein  30.65 
 
 
499 aa  127  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  35.67 
 
 
472 aa  122  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0036  hypothetical protein  35.06 
 
 
460 aa  120  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7582  hypothetical protein  35.56 
 
 
409 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117835  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1000  hypothetical protein  33.15 
 
 
492 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0963  hypothetical protein  33.15 
 
 
493 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.373348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0941  hypothetical protein  31.3 
 
 
493 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6846  hypothetical protein  34.46 
 
 
414 aa  109  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5639  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
496 aa  108  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  0.277349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2605  hypothetical protein  33.17 
 
 
1680 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6809  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1299  hypothetical protein  35.84 
 
 
1763 aa  106  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1006  hypothetical protein  34.02 
 
 
634 aa  106  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0103184 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>