28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0036 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0036  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  907    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1331  hypothetical protein  45.74 
 
 		 540 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1124  hypothetical protein  44.14 
 
 		 518 aa  205  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4085  hypothetical protein  45.42 
 
 		 553 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.414268  normal  0.0981997 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2964  hypothetical protein  45.78 
 
 		 540 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1851  hypothetical protein  42.61 
 
 		 546 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4773  hypothetical protein  38.32 
 
 		 534 aa  196  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3893  hypothetical protein  49.28 
 
 		 541 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0724599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7582  hypothetical protein  36.36 
 
 		 409 aa  190  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  45.2 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_004310  BR1681  hypothetical protein  28.97 
 
 		 465 aa  149  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571535  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1625  hypothetical protein  28.77 
 
 		 465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3157  hypothetical protein  37.93 
 
 		 544 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0907045  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1232  hypothetical protein  27.87 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5639  putative CheA signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 		 496 aa  134  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  0.277349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3345  hypothetical protein  34.25 
 
 		 841 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172568  decreased coverage  0.00479246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1006  hypothetical protein  35.27 
 
 		 634 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0103184 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3088  hypothetical protein  33.85 
 
 		 836 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671976  normal  0.139652 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2615  hypothetical protein  30.87 
 
 		 766 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3542  hypothetical protein  31.82 
 
 		 715 aa  124  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652953  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2605  hypothetical protein  37.29 
 
 		 1680 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1299  hypothetical protein  38.2 
 
 		 1763 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0286  hypothetical protein  20.99 
 
 		 499 aa  100  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1000  hypothetical protein  60.29 
 
 		 492 aa  87  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0963  hypothetical protein  60.29 
 
 		 493 aa  87  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.373348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0941  hypothetical protein  59.38 
 
 		 493 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6846  hypothetical protein  55.88 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  40.62 
 
 		 277 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>