33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1006 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1006  hypothetical protein  100 
 
 		 634 aa  1223    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0103184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5639  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 496 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  0.277349 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7582  hypothetical protein  32.61 
 
 		 409 aa  142  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117835  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1331  hypothetical protein  37.56 
 
 		 540 aa  137  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4085  hypothetical protein  37.57 
 
 		 553 aa  136  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.414268  normal  0.0981997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0963  hypothetical protein  32.67 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.373348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0941  hypothetical protein  31.62 
 
 		 493 aa  134  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1124  hypothetical protein  35.98 
 
 		 518 aa  128  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1851  hypothetical protein  36.16 
 
 		 546 aa  127  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4773  hypothetical protein  30.97 
 
 		 534 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3893  hypothetical protein  31.39 
 
 		 541 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0724599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0036  hypothetical protein  38.75 
 
 		 460 aa  117  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3157  hypothetical protein  37.18 
 
 		 544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0907045  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3345  hypothetical protein  39.51 
 
 		 841 aa  107  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172568  decreased coverage  0.00479246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3088  hypothetical protein  38.89 
 
 		 836 aa  107  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671976  normal  0.139652 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3542  hypothetical protein  32.29 
 
 		 715 aa  107  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652953  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  35.06 
 
 		 472 aa  105  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2615  hypothetical protein  34.62 
 
 		 766 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1232  hypothetical protein  31.45 
 
 		 479 aa  94.4  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1681  hypothetical protein  26.89 
 
 		 465 aa  92  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571535  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1625  hypothetical protein  26.89 
 
 		 465 aa  89.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2605  hypothetical protein  29.76 
 
 		 1680 aa  87  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1299  hypothetical protein  33.52 
 
 		 1763 aa  85.1  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1000  hypothetical protein  58.82 
 
 		 492 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6846  hypothetical protein  58.82 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0286  hypothetical protein  28.79 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2964  hypothetical protein  51.32 
 
 		 540 aa  76.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  41.25 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  24.68 
 
 		 3521 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  25.25 
 
 		 3472 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  25.25 
 
 		 3471 aa  52  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  24.31 
 
 		 2449 aa  46.6  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  24.65 
 
 		 3409 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>