28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1124 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1124  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1022    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1331  hypothetical protein  65.13 
 
 		 540 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4085  hypothetical protein  62.81 
 
 		 553 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.414268  normal  0.0981997 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2964  hypothetical protein  85.47 
 
 		 540 aa  588  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4773  hypothetical protein  62.61 
 
 		 534 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3893  hypothetical protein  65.09 
 
 		 541 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0724599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1851  hypothetical protein  61.29 
 
 		 546 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  64.16 
 
 		 472 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0036  hypothetical protein  53.45 
 
 		 460 aa  190  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3157  hypothetical protein  48.31 
 
 		 544 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0907045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2605  hypothetical protein  42.99 
 
 		 1680 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1232  hypothetical protein  41.41 
 
 		 479 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1625  hypothetical protein  39.89 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1681  hypothetical protein  39.89 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571535  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0963  hypothetical protein  40 
 
 		 493 aa  154  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.373348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1000  hypothetical protein  40 
 
 		 492 aa  154  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3088  hypothetical protein  38.16 
 
 		 836 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671976  normal  0.139652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1299  hypothetical protein  44.63 
 
 		 1763 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0941  hypothetical protein  38.57 
 
 		 493 aa  151  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2615  hypothetical protein  39.38 
 
 		 766 aa  150  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3542  hypothetical protein  38.12 
 
 		 715 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3345  hypothetical protein  39.2 
 
 		 841 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172568  decreased coverage  0.00479246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5639  putative CheA signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 496 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  0.277349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6846  hypothetical protein  41.57 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7582  hypothetical protein  40 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117835  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1006  hypothetical protein  35.98 
 
 		 634 aa  128  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0103184 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0286  hypothetical protein  29.01 
 
 		 499 aa  113  8.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  43.48 
 
 		 277 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>