30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3893 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1331  hypothetical protein  86.36 
 
 		 540 aa  863    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4085  hypothetical protein  66.25 
 
 		 553 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.414268  normal  0.0981997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3893  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1063    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0724599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4773  hypothetical protein  74.55 
 
 		 534 aa  735    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43696  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1124  hypothetical protein  63.88 
 
 		 518 aa  609  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1851  hypothetical protein  60.42 
 
 		 546 aa  569  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2964  hypothetical protein  70.43 
 
 		 540 aa  473  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  64.57 
 
 		 472 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0036  hypothetical protein  47.87 
 
 		 460 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2605  hypothetical protein  35.74 
 
 		 1680 aa  174  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3157  hypothetical protein  45.36 
 
 		 544 aa  173  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0907045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1299  hypothetical protein  44.17 
 
 		 1763 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1232  hypothetical protein  41.9 
 
 		 479 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1681  hypothetical protein  38.39 
 
 		 465 aa  152  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571535  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1625  hypothetical protein  38.39 
 
 		 465 aa  152  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0963  hypothetical protein  34.03 
 
 		 493 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.373348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1000  hypothetical protein  34.03 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3088  hypothetical protein  38.42 
 
 		 836 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671976  normal  0.139652 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2615  hypothetical protein  37.8 
 
 		 766 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0941  hypothetical protein  34.17 
 
 		 493 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3345  hypothetical protein  38.2 
 
 		 841 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172568  decreased coverage  0.00479246 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3542  hypothetical protein  36.36 
 
 		 715 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652953  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1006  hypothetical protein  33.11 
 
 		 634 aa  134  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0103184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7582  hypothetical protein  34.34 
 
 		 409 aa  133  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6846  hypothetical protein  41.34 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5639  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 496 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  0.277349 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0286  hypothetical protein  28.42 
 
 		 499 aa  113  7.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  41.18 
 
 		 277 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  28.42 
 
 		 2179 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  28.77 
 
 		 2272 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>