27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1232 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1232  hypothetical protein  100 
 
 
479 aa  969    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1681  hypothetical protein  72.67 
 
 
465 aa  652    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571535  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1625  hypothetical protein  72.46 
 
 
465 aa  650    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3157  hypothetical protein  47.69 
 
 
544 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0907045  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3088  hypothetical protein  40.44 
 
 
836 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671976  normal  0.139652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3345  hypothetical protein  37.44 
 
 
841 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172568  decreased coverage  0.00479246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2615  hypothetical protein  40.35 
 
 
766 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3542  hypothetical protein  36.66 
 
 
715 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652953  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0286  hypothetical protein  27.87 
 
 
499 aa  179  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1124  hypothetical protein  41.41 
 
 
518 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2964  hypothetical protein  42.93 
 
 
540 aa  156  8e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1851  hypothetical protein  40.64 
 
 
546 aa  156  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4773  hypothetical protein  41.35 
 
 
534 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43696  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4085  hypothetical protein  40.64 
 
 
553 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.414268  normal  0.0981997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3893  hypothetical protein  42.78 
 
 
541 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0724599  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1331  hypothetical protein  39.71 
 
 
540 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7582  hypothetical protein  37.29 
 
 
409 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117835  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0036  hypothetical protein  35.5 
 
 
460 aa  124  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6846  hypothetical protein  37.29 
 
 
414 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0941  hypothetical protein  35.94 
 
 
493 aa  117  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0963  hypothetical protein  34.62 
 
 
493 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.373348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1000  hypothetical protein  35.39 
 
 
492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5639  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
496 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  0.277349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  32.56 
 
 
472 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1006  hypothetical protein  31.45 
 
 
634 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0103184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2605  hypothetical protein  29.13 
 
 
1680 aa  87.4  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6809  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1299  hypothetical protein  31.82 
 
 
1763 aa  86.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>