57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03861 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4416  putative lipoprotein  91.83 
 
 
698 aa  1359    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00872007 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4268  putative lipoprotein  99.43 
 
 
698 aa  1438    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1100  putative lipoprotein  64.37 
 
 
698 aa  948    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000283617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4577  putative lipoprotein  99.14 
 
 
698 aa  1430    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2612  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  64.08 
 
 
698 aa  943    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.161278 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4001  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  99.86 
 
 
698 aa  1443    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.501947 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4490  putative lipoprotein  99 
 
 
698 aa  1434    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197031  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2331  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcA  64.37 
 
 
698 aa  947    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175694  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4534  putative lipoprotein  99.28 
 
 
698 aa  1434    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4567  putative lipoprotein  91.98 
 
 
698 aa  1361    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4567  hypothetical protein  92.12 
 
 
698 aa  1362    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03901  predicted porin  100 
 
 
698 aa  1446    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4482  putative lipoprotein  92.26 
 
 
698 aa  1363    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4619  putative lipoprotein  92.26 
 
 
698 aa  1361    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1220  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcA  64.37 
 
 
698 aa  947    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221159  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5508  putative lipoprotein  99 
 
 
698 aa  1434    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00994  hypothetical protein  64.37 
 
 
698 aa  947    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.579327  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03861  hypothetical protein  100 
 
 
698 aa  1446    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2843  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  52.06 
 
 
714 aa  689    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1324  hypothetical protein  53.36 
 
 
707 aa  711    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0971322  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3010  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  52.52 
 
 
711 aa  702    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0811368  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0234  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  91.26 
 
 
698 aa  1348    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.261966  normal  0.795052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00987  hypothetical protein  64.37 
 
 
698 aa  947    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.570303  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2659  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  64.37 
 
 
698 aa  946    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.627573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3968  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  99.71 
 
 
698 aa  1441    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00054  Fusion of WbfC- and WbfB-like uncharacterized  45.76 
 
 
700 aa  606  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3204  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  46.13 
 
 
709 aa  599  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.497795  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1393  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  45.49 
 
 
791 aa  592  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.244173  normal  0.032631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1340  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  45.23 
 
 
787 aa  591  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235359 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3159  hypothetical protein  44.71 
 
 
792 aa  590  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2880  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  44.24 
 
 
789 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000128107  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1405  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  45.09 
 
 
787 aa  588  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3009  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  44.83 
 
 
787 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.383324  normal  0.742056 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1496  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  44.37 
 
 
789 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174983  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2863  hypothetical protein  44.16 
 
 
787 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126176  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0272  putative outer membrane protein  43.45 
 
 
735 aa  578  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.635582  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2523  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  43.71 
 
 
788 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0789  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  43.42 
 
 
737 aa  548  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.298887  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00683  hypothetical protein  41.94 
 
 
720 aa  543  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001791  YjbH outer membrane lipoprotein  40.75 
 
 
731 aa  535  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3830  hypothetical protein  43.13 
 
 
692 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.491022  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0622  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  40.82 
 
 
704 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.944587  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1942  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  40.54 
 
 
990 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1197  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  39.29 
 
 
1031 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0938466  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1957  hypothetical protein  40.14 
 
 
976 aa  439  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52891  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0655  putative lipoprotein  40.14 
 
 
995 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0562  putative lipoprotein  40 
 
 
995 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1988  otnG protein  39.26 
 
 
972 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3793  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  39.97 
 
 
1261 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3271  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  36.4 
 
 
981 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000771318 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3858  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  31.15 
 
 
746 aa  283  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00089637  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1187  hypothetical protein  28.93 
 
 
722 aa  256  9e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2849  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  28.51 
 
 
722 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.801609 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4134  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  29.84 
 
 
731 aa  252  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.337752  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2626  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  28.72 
 
 
720 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0513  hypothetical protein  27.46 
 
 
758 aa  45.8  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2795  hypothetical protein  27.95 
 
 
792 aa  44.3  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>