74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_36920 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  100 
 
 
86 aa  164  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  60.47 
 
 
86 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  55.17 
 
 
87 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  58.57 
 
 
95 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  48.28 
 
 
87 aa  80.1  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  47.13 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  57.14 
 
 
87 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  48.84 
 
 
87 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  48.28 
 
 
87 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  47.13 
 
 
87 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  47.13 
 
 
87 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  43.53 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  43.53 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  48.86 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  45.05 
 
 
91 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  44.71 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  53.45 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  47.06 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  47.06 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  47.06 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  47.06 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  47.06 
 
 
86 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  47.06 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  47.06 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.06 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  54.17 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1874  addiction module antitoxin  44.59 
 
 
85 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  0.190999 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  53.06 
 
 
63 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  54.17 
 
 
64 aa  55.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  57.14 
 
 
86 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  55.1 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  48.98 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3344  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218664  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4666  RelB antitoxin  46.94 
 
 
101 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0384532  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7897  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  46.94 
 
 
102 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373381  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8393  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  46.94 
 
 
102 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3232  addiction module antitoxin  46.94 
 
 
102 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2863  addiction module antitoxin  46.15 
 
 
87 aa  50.8  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421266  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  51.02 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0983  RelB antitoxin  43.21 
 
 
90 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  46.94 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  45.83 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35.16 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4715  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  40.32 
 
 
80 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.39 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  42.42 
 
 
85 aa  47.4  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0434  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  46.51 
 
 
80 aa  47.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  33.33 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4829  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  44.19 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  43.75 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4700  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  44.19 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.85974 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4795  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  44.19 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4850  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  44.19 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  42.55 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2510  RelB antitoxin  36.92 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.400211  normal  0.98229 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0435  DNA-damage-inducible protein J, putative  37.78 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0978363  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2239  addiction module antitoxin  42.86 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  44.9 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0393  hypothetical protein  31.03 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00921245  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0507  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  33.78 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.038501 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  40.82 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4331  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  40.43 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4468  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  40.43 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.791173  normal  0.577271 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4646  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  40.43 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4396  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  40.43 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.921307 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0017  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  43.18 
 
 
79 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2071  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  43.18 
 
 
79 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4262  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  43.18 
 
 
79 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  43.18 
 
 
79 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2575  addiction module antitoxin  32.14 
 
 
95 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.167878 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2078  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  43.18 
 
 
79 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0200075  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  40.91 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0088475  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1749  RelB antitoxin  33.93 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00498154  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1074  putative DNA-damage-inducibile protein  31.71 
 
 
89 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>