242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7072 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  590  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6123  hypothetical protein  61.56 
 
 		 302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0940  integral membrane protein  39.93 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  43.33 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1657  hypothetical protein  37.62 
 
 		 307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.907387  normal  0.515253 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.41 
 
 		 318 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3336  hypothetical protein  37.58 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547457  normal  0.396992 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3621  hypothetical protein  41.11 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  40.93 
 
 		 303 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1421  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.66 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36520  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  38.33 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.516696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4504  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.97 
 
 		 348 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.79 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  31.4 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  31.4 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  28.43 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  29.3 
 
 		 294 aa  105  8e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.45 
 
 		 312 aa  96.3  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  28.57 
 
 		 288 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  28.57 
 
 		 288 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  27.61 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  26.42 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  28.67 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3937  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.59 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000721234  decreased coverage  0.000464529 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.76 
 
 		 295 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  28.57 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  27.55 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  27.46 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  27.52 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  27.52 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  27.91 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  27.52 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  27.52 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  26.53 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 		 283 aa  87.4  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  26.58 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  25.91 
 
 		 288 aa  87  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  25.91 
 
 		 288 aa  86.3  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  29.85 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.62 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  25.29 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  28.42 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  26.44 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  26.73 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  27.82 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.5 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  30.03 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.28 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.28 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03280  predicted permease, DMT superfamily  29.34 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  27.11 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.5 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  27.17 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  26.76 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  23.1 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.23 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.86 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  26.55 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  24.82 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  25.8 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  23.59 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  27.02 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  25.44 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.89 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  26.22 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  25.74 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  28.87 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  28.38 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.8 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0053  hypothetical protein  28.96 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.261978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  25.68 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  25.61 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.79 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.373624  normal  0.289625 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  26.94 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  24.83 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  23.59 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  25.75 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  26.59 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1606  hypothetical protein  26.79 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  26.37 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  25.35 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  25.93 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  24.27 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0298  hypothetical protein  27.08 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2461  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.508316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  24.47 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.61 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  27.02 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>