More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1002 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  100 
 
 
300 aa  605  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1554  cation diffusion facilitator family transporter  85.23 
 
 
301 aa  500  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.199907  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  76.32 
 
 
307 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3015  cation diffusion facilitator family transporter  73.03 
 
 
306 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3105  cation diffusion facilitator family transporter  73.03 
 
 
306 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1989  cation diffusion facilitator family transporter  66.78 
 
 
303 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1040  cation diffusion facilitator family transporter  53.87 
 
 
308 aa  332  7.000000000000001e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0941  cation efflux protein  53.58 
 
 
308 aa  309  4e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.754529  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  38.79 
 
 
301 aa  194  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1437  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.5 
 
 
303 aa  178  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.929913 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  39.5 
 
 
305 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 
312 aa  167  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  36.92 
 
 
285 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1011  cation diffusion facilitator family transporter  31.12 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  34.89 
 
 
459 aa  142  9e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  34.03 
 
 
308 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  33.8 
 
 
295 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  30.74 
 
 
337 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  30.04 
 
 
396 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  31.6 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  31.8 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  30.41 
 
 
388 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  31.93 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  34.49 
 
 
317 aa  125  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  31.97 
 
 
302 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  30.74 
 
 
307 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  30.45 
 
 
309 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  30.61 
 
 
302 aa  123  4e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 
312 aa  123  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 
317 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  30.6 
 
 
311 aa  123  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  30.63 
 
 
307 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  30.63 
 
 
307 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  30.04 
 
 
307 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  27.1 
 
 
422 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  30.04 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  31.01 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  30.87 
 
 
380 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  30.87 
 
 
380 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 
302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  30.43 
 
 
306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  29.54 
 
 
311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  29.33 
 
 
306 aa  119  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 
306 aa  119  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  32.64 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  29.43 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  32.98 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  33.08 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  30.31 
 
 
385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  30.31 
 
 
385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  28.77 
 
 
297 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  29.47 
 
 
385 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  31.74 
 
 
460 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  32.04 
 
 
296 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  29.43 
 
 
293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  32.06 
 
 
295 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  29.89 
 
 
311 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  30.88 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  31.06 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  29.82 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  29.45 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  30.31 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  30.49 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 
299 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  28.07 
 
 
297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  29.45 
 
 
418 aa  113  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  28.87 
 
 
298 aa  112  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  28.76 
 
 
300 aa  112  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  29.11 
 
 
396 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  29.11 
 
 
396 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  29.11 
 
 
396 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  29.11 
 
 
396 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  29.11 
 
 
396 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  29.11 
 
 
396 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  32.05 
 
 
304 aa  112  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  29.12 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  29.12 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  28.67 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  31.08 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  29.58 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  31.11 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  27.14 
 
 
392 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  29.08 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  29.23 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  27.7 
 
 
387 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  29.08 
 
 
296 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  29.08 
 
 
296 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  31.08 
 
 
459 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  29.08 
 
 
296 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  29.12 
 
 
293 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  30.95 
 
 
302 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  29.12 
 
 
293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  28.47 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  29.12 
 
 
293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  29.58 
 
 
418 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  30.07 
 
 
305 aa  109  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  32.04 
 
 
295 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  30.55 
 
 
320 aa  108  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>