152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0434 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0434  protein of unknown function DUF195  100 
 
 		 449 aa  907    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00288776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0817  protein of unknown function DUF195  52.68 
 
 		 433 aa  349  5e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.028407  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0014  hypothetical protein  45.12 
 
 		 450 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000106215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3231  protein of unknown function DUF195  45.32 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000252546  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0984  hypothetical protein  44.07 
 
 		 495 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0980  hypothetical protein  44.07 
 
 		 495 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0625  hypothetical protein  43.48 
 
 		 491 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1104  hypothetical protein  43.48 
 
 		 491 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0514  RmuC domain-containing protein  45.83 
 
 		 491 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2497  RmuC domain-containing protein  45.83 
 
 		 491 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0129399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2785  RmuC domain-containing protein  45.83 
 
 		 491 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1820  RmuC domain-containing protein  45.83 
 
 		 491 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1701  RmuC domain-containing protein  45.09 
 
 		 491 aa  333  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0384449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4217  hypothetical protein  44.5 
 
 		 492 aa  332  8e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2924  RmuC domain-containing protein  45.73 
 
 		 491 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0269427  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2808  putative DNA recombination protein rmuC  45.73 
 
 		 491 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.209602  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2869  putative DNA recombination protein RmuC  45.73 
 
 		 491 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342471  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0339  hypothetical protein  43.52 
 
 		 426 aa  330  3e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2445  hypothetical protein  50.88 
 
 		 448 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1623  hypothetical protein  45.62 
 
 		 441 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.929748  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1035  hypothetical protein  44.16 
 
 		 457 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.371122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2199  hypothetical protein  52.05 
 
 		 492 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.134228 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1541  protein of unknown function DUF195  53.62 
 
 		 450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.756078  hitchhiker  0.00318152 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0812  hypothetical protein  49.09 
 
 		 494 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.465161  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2280  hypothetical protein  44.69 
 
 		 488 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0930  protein of unknown function DUF195  51.36 
 
 		 450 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2166  hypothetical protein  47.71 
 
 		 466 aa  326  6e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.171242  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1063  hypothetical protein  43.25 
 
 		 491 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00852536  normal  0.199867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3077  hypothetical protein  44.82 
 
 		 445 aa  323  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.194725  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2489  hypothetical protein  42.48 
 
 		 566 aa  323  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262893  normal  0.047017 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1056  hypothetical protein  52.37 
 
 		 481 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244381  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1767  hypothetical protein  48.67 
 
 		 424 aa  323  4e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.258411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0011  hypothetical protein  43.55 
 
 		 514 aa  323  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1371  protein of unknown function DUF195  42.23 
 
 		 566 aa  323  4e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0965  protein of unknown function DUF195  43.69 
 
 		 490 aa  323  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252696  normal  0.10858 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1774  hypothetical protein  43.17 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1067  protein of unknown function DUF195  44.11 
 
 		 508 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2053  hypothetical protein  47.34 
 
 		 479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000533469 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2928  protein of unknown function DUF195  51.18 
 
 		 482 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22926  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1600  hypothetical protein  47.15 
 
 		 444 aa  318  7.999999999999999e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0970446  normal  0.868802 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0900  protein of unknown function DUF195  43.79 
 
 		 490 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0908545 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4032  protein of unknown function DUF195  47.03 
 
 		 427 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817226  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1775  protein of unknown function DUF195  45.36 
 
 		 455 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03225  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein, putative  45.6 
 
 		 774 aa  310  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0340  protein of unknown function DUF195  47.42 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0320  protein of unknown function DUF195  47.72 
 
 		 440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3924  hypothetical protein  52.19 
 
 		 426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.031457  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0189  protein of unknown function DUF195  43.97 
 
 		 445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4064  protein of unknown function DUF195  45.55 
 
 		 426 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3304  hypothetical protein  42.79 
 
 		 474 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1514  hypothetical protein  47.77 
 
 		 495 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174369 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2070  hypothetical protein  42.19 
 
 		 621 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2052  protein of unknown function DUF195  42.51 
 
 		 440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4024  protein of unknown function DUF195  47.51 
 
 		 518 aa  300  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4737  hypothetical protein  43.62 
 
 		 509 aa  300  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543565 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1755  hypothetical protein  41.2 
 
 		 456 aa  299  6e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1823  competence-induced protein  40.97 
 
 		 456 aa  298  2e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2194  hypothetical protein  46.45 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0517  protein of unknown function DUF195  46.69 
 
 		 412 aa  290  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0973861  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0015  protein of unknown function DUF195  48.04 
 
 		 465 aa  283  6.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1279  hypothetical protein  35.51 
 
 		 451 aa  246  8e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2949  protein of unknown function DUF195  39.6 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.173006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1261  hypothetical protein  27.7 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.263937 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf523  RmuC domain protein  24.65 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1874  hypothetical protein  26.13 
 
 		 380 aa  121  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1017  hypothetical protein  26.22 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0984  hypothetical protein  25.59 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1309  RmuC family protein  24.7 
 
 		 439 aa  114  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000109458  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1368  RmuC family protein  24.7 
 
 		 426 aa  114  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000211389  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0733  protein of unknown function DUF195  27.18 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390506  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0770  hypothetical protein  26.28 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.33897  normal  0.0446881 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4048  hypothetical protein  29.41 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2464  protein of unknown function DUF195  26.84 
 
 		 417 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0853612  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3589  hypothetical protein  25.55 
 
 		 457 aa  103  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0260  hypothetical protein  26.37 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1094  hypothetical protein  31.47 
 
 		 378 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0103  hypothetical protein  27.64 
 
 		 411 aa  96.3  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2757  hypothetical protein  31.08 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0364  protein of unknown function DUF195  28.52 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.659068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2934  hypothetical protein  30.68 
 
 		 378 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.323227  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3251  hypothetical protein  27.53 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0418  hypothetical protein  26.84 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333836  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3348  hypothetical protein  27.27 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1343  hypothetical protein  27.87 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.47326  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0977  hypothetical protein  28.28 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230819  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1036  hypothetical protein  28.28 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0614  hypothetical protein  21.26 
 
 		 358 aa  79.7  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0114887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  25.55 
 
 		 503 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0624  protein of unknown function DUF195  27.13 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0082  hypothetical protein  26.32 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552116  normal  0.0373517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7338  hypothetical protein  27.53 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0070  protein of unknown function DUF195  24.71 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1318  RmuC domain-containing protein  22.12 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0672  hypothetical protein  26.69 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0802  hypothetical protein  27.72 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0054  protein of unknown function DUF195  24.33 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0396874 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  26.71 
 
 		 531 aa  71.2  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0466  hypothetical protein  25.41 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  22.99 
 
 		 532 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  25.88 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>