44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0530 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  51.12 
 
 
1433 aa  1045    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  51.61 
 
 
1431 aa  1069    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0530  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 
1379 aa  2530    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  51.46 
 
 
1433 aa  1068    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 
1338 aa  347  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  20.75 
 
 
1225 aa  105  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0249  hypothetical protein  30.73 
 
 
1238 aa  73.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.868724  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0260  hypothetical protein  30.93 
 
 
1238 aa  72.4  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  24.4 
 
 
753 aa  69.3  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0238  hypothetical protein  29.64 
 
 
1239 aa  68.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  29.35 
 
 
634 aa  68.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  30.08 
 
 
634 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  28.48 
 
 
632 aa  66.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  28.02 
 
 
639 aa  65.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  29.59 
 
 
641 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  24.17 
 
 
672 aa  60.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  20.92 
 
 
1028 aa  58.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  23.46 
 
 
621 aa  57.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  23.46 
 
 
621 aa  57.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  22.63 
 
 
1257 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  28.97 
 
 
637 aa  55.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  29.57 
 
 
635 aa  55.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0260  hypothetical protein  27.66 
 
 
1241 aa  55.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379172  normal  0.583733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3717  hypothetical protein  35.22 
 
 
559 aa  54.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.912056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  26.08 
 
 
1253 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  23.37 
 
 
673 aa  55.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  31.98 
 
 
624 aa  53.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  30.17 
 
 
638 aa  52.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  30.17 
 
 
638 aa  52  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  27.31 
 
 
616 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  25.82 
 
 
647 aa  50.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  30.81 
 
 
624 aa  50.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  26.99 
 
 
704 aa  50.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 
1256 aa  49.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 
1256 aa  49.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 
878 aa  48.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.5 
 
 
810 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  26.98 
 
 
684 aa  47.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  35.16 
 
 
1213 aa  46.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  25.69 
 
 
594 aa  46.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
739 aa  45.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.2 
 
 
804 aa  45.1  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  34.33 
 
 
502 aa  45.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  23.04 
 
 
1042 aa  45.1  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>