66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_R0050 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.840462  normal  0.934802 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0696891  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.264457  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0042  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535149 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0058  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0007  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0010  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    97.62 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA50  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.391222  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0009  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0024  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.154328 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0006  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.806028  normal  0.553629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0050  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.822506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0052  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 86 bp  60  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0032  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0027  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130394  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0011  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0572  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0025  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0001623  hitchhiker  0.000378957 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.549944  normal  0.0458093 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu04  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617497 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28960  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.858981  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1413  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.192741 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4763  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000114047  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5720  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0614  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114881  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0307  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0539  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.1762e-32 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0070  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1379  tRNA-Leu  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.107567 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R29  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0068  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.285186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0731155  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000183517  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0433  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00310588  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0088  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6024  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658515  normal  0.58924 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0092  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257309  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0012  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.594813  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000251522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>