40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_R0011 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00310588  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0041  tRNA-Leu  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0043  tRNA-Leu  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217988  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0045  tRNA-Leu  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0040  tRNA-Leu  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0021  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.729183  normal  0.627845 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0024  tRNA-Leu  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0040  tRNA-Leu  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14017  tRNA-Leu  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.285332  normal  0.0623737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0050  tRNA-Leu  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.858981  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32170  tRNA-Leu  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.933066  normal  0.161534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0065  tRNA-Leu  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0023  tRNA-Leu  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000369375 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07920  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0780487  normal  0.280122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26000  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0016  tRNA-Leu  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.0561514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07980  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096426  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0003  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6024  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658515  normal  0.58924 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000356582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0018  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00379484  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0018  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446903  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0047  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.232524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0031  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0049  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000532308  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00150158  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0021  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.443541  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000210278  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0562701  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0025  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19630  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93343  normal  0.0188921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28960  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363036 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0012  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0001521  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000251522  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.840462  normal  0.934802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>