33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_R0043 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217988  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.760508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0040  tRNA-Leu  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14017  tRNA-Leu  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.285332  normal  0.0623737 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0041  tRNA-Leu  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0025  tRNA-Leu  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0021  tRNA-Leu  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.729183  normal  0.627845 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0059  tRNA-Leu  93.24 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.495199  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304311  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0011  tRNA-Leu  91.07 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00310588  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0065  tRNA-Leu  88.71 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07980  tRNA-Leu  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096426  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0023  tRNA-Leu  97.3 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000369375 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07920  tRNA-Leu  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0780487  normal  0.280122 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  96.97 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  96.77 
 
 
90 bp  54  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  96.77 
 
 
90 bp  54  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0016  tRNA-Leu  85.71 
 
 
77 bp  54  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.0561514 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  96.77 
 
 
90 bp  54  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0030  tRNA-Leu  85.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32170  tRNA-Leu  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.933066  normal  0.161534 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1225  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000848373  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0025  tRNA-Leu  96.43 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0221479  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0005  tRNA-Leu  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0506914  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000696773  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0043  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021552  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0027  tRNA-Leu  96.43 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161341  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0045  tRNA-Leu  85.45 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  93.55 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0013  tRNA-Leu  93.55 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.111506  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0050  tRNA-Leu  82.43 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.858981  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0052  tRNA-Leu  89.47 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>